20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0984 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  27.06 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  26.81 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  25.95 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  26.52 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  23.55 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  31.93 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 2142 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  31.93 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  31.09 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  26.52 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  26.13 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  33.68 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  24 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  25.78 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  26.67 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  27.97 
 
 		 268 aa  42.7  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  23.3 
 
 		 412 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>