39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0673 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  100 
 
 
390 aa  802    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  50.54 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  37.96 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  37.68 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  37.68 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  35.56 
 
 
378 aa  209  5e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  33.05 
 
 
417 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  26.84 
 
 
367 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  26.84 
 
 
367 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  28.5 
 
 
460 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  28.24 
 
 
460 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  29.59 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  28.11 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  26.26 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  24.79 
 
 
376 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  28.4 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  26.11 
 
 
368 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  25.14 
 
 
455 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  24.59 
 
 
370 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  28.11 
 
 
343 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  26.35 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  27.4 
 
 
380 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  24.71 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  27.84 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  23.32 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  21.58 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 
2142 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  24.92 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  23.62 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  22 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  25.07 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  39.44 
 
 
291 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  39.44 
 
 
291 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  35.9 
 
 
291 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  32.05 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  29.41 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  23.55 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  25.93 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>