37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1978 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  100 
 
 		 380 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  77.37 
 
 		 380 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  45.04 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  39.27 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  35.36 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  33.88 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  27.84 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  24.34 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  23.96 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  26.05 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  23.8 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  23.8 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  34.17 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  21.24 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  28.32 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  33.33 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  33.33 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  34.41 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  25.47 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  22.59 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  24.84 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  25 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.57 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  24.24 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  24.46 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  31.25 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  32.54 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 2142 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  27.2 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  27.93 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  27.93 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  23.81 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  26.8 
 
 		 402 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  25.4 
 
 		 455 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  31.13 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  24.58 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  27.83 
 
 		 540 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>