More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0600 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  78.22 
 
 
505 aa  836    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  73.66 
 
 
505 aa  775    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  82.38 
 
 
505 aa  879    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  100 
 
 
505 aa  1013    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  50.79 
 
 
507 aa  513  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  51.19 
 
 
510 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  50.58 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  50.99 
 
 
516 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  51.28 
 
 
513 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  51.77 
 
 
518 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  51.27 
 
 
520 aa  502  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.48 
 
 
510 aa  498  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  50.88 
 
 
533 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  50.5 
 
 
507 aa  495  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  49.8 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.41 
 
 
510 aa  491  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  50.97 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  51.27 
 
 
517 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  49.8 
 
 
533 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  49.8 
 
 
560 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  49.8 
 
 
509 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  51.09 
 
 
510 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  49.8 
 
 
510 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  50.49 
 
 
520 aa  488  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.46 
 
 
526 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  49.02 
 
 
537 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  50.3 
 
 
516 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  49.51 
 
 
511 aa  485  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  48.25 
 
 
542 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  48.62 
 
 
515 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  48.62 
 
 
515 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  48.62 
 
 
515 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  48.42 
 
 
513 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  48.62 
 
 
512 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  48.62 
 
 
512 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  49.41 
 
 
510 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  50.1 
 
 
516 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  48.25 
 
 
542 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  48.03 
 
 
507 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  49.02 
 
 
560 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  49.9 
 
 
516 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  48.81 
 
 
512 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  48.72 
 
 
517 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  46.78 
 
 
528 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  48.62 
 
 
512 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  48.62 
 
 
515 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  51.56 
 
 
516 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  46.59 
 
 
528 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  50.19 
 
 
526 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  50.1 
 
 
556 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  48.62 
 
 
512 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  48.55 
 
 
575 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  48.42 
 
 
512 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  47.08 
 
 
542 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  49.31 
 
 
522 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  47.08 
 
 
528 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  50.77 
 
 
523 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  48.73 
 
 
515 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  48.42 
 
 
512 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  51.08 
 
 
519 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  50.2 
 
 
513 aa  478  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  50.88 
 
 
516 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  49.7 
 
 
511 aa  478  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  48.62 
 
 
511 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  48.23 
 
 
517 aa  480  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  48.94 
 
 
511 aa  479  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  46.39 
 
 
528 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  47.86 
 
 
575 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  50.7 
 
 
501 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  48.81 
 
 
509 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  49.01 
 
 
509 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  47.64 
 
 
517 aa  480  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  50.1 
 
 
547 aa  480  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  49.9 
 
 
534 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  50.5 
 
 
501 aa  477  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  48.04 
 
 
533 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  46.65 
 
 
514 aa  475  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  48.26 
 
 
513 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  49.4 
 
 
511 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  47.52 
 
 
522 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  49.21 
 
 
506 aa  478  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  49.31 
 
 
531 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  50.78 
 
 
515 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  48.04 
 
 
520 aa  477  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  49.22 
 
 
513 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  48.16 
 
 
513 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  48.46 
 
 
513 aa  473  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  50 
 
 
511 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  48.93 
 
 
520 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  50.1 
 
 
534 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  48.53 
 
 
519 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  48.53 
 
 
519 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  48.64 
 
 
518 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  48.81 
 
 
513 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  48.52 
 
 
511 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  48.81 
 
 
513 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  49.01 
 
 
510 aa  474  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  48.53 
 
 
519 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  50.87 
 
 
517 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  48.54 
 
 
525 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>