More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1516 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  73.66 
 
 
505 aa  767    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  100 
 
 
505 aa  1016    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  78.42 
 
 
505 aa  833    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  82.38 
 
 
505 aa  879    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  52.17 
 
 
513 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  51.19 
 
 
509 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  50.39 
 
 
528 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  50.79 
 
 
516 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  49.8 
 
 
510 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  50 
 
 
507 aa  499  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.01 
 
 
510 aa  488  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  50.39 
 
 
518 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  50.68 
 
 
517 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  50.39 
 
 
527 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  48.71 
 
 
507 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  50.49 
 
 
522 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  49.51 
 
 
520 aa  488  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  47.83 
 
 
517 aa  484  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  49.7 
 
 
516 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  49.51 
 
 
533 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  48.05 
 
 
537 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  49.51 
 
 
516 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.71 
 
 
510 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  50.49 
 
 
556 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  49.7 
 
 
516 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  49.01 
 
 
510 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.88 
 
 
526 aa  485  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  50.78 
 
 
517 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  48.62 
 
 
510 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  50.69 
 
 
517 aa  480  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  46.46 
 
 
507 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  46.89 
 
 
542 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  46.89 
 
 
542 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  48.62 
 
 
512 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  49.22 
 
 
526 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  46.2 
 
 
528 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  47.63 
 
 
515 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  47.63 
 
 
515 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  47.63 
 
 
515 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  45.91 
 
 
542 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  50.98 
 
 
517 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  47.63 
 
 
512 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  48.15 
 
 
511 aa  475  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  47.63 
 
 
512 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  45.81 
 
 
528 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  48.42 
 
 
512 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  50.69 
 
 
516 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  49.7 
 
 
510 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  46.89 
 
 
575 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  47.64 
 
 
517 aa  477  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  46.2 
 
 
528 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  47.34 
 
 
517 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  45.81 
 
 
528 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  47.83 
 
 
512 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  47.83 
 
 
512 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  47.83 
 
 
512 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  50.1 
 
 
534 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  47.83 
 
 
515 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  46.89 
 
 
575 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  49.32 
 
 
547 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  47.63 
 
 
512 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  47.43 
 
 
512 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  49.12 
 
 
520 aa  475  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  46.85 
 
 
514 aa  473  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  47.28 
 
 
533 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  48.84 
 
 
523 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  48.32 
 
 
511 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  47.24 
 
 
533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  48.73 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  47.54 
 
 
560 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  50.3 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  46.98 
 
 
528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  48.35 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  48.92 
 
 
520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  47.57 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  47.23 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  48.16 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  49.32 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  49.22 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  46.98 
 
 
528 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  47.72 
 
 
511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  51.08 
 
 
519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  49.32 
 
 
534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  47.35 
 
 
560 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  47.67 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  46.52 
 
 
507 aa  468  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  47.48 
 
 
518 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  47.02 
 
 
511 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  48.44 
 
 
522 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  50.1 
 
 
501 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  48.41 
 
 
506 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  45.56 
 
 
511 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  47.42 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  48.72 
 
 
531 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  48.14 
 
 
520 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  48.73 
 
 
524 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  48.73 
 
 
520 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  48.83 
 
 
529 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  48.73 
 
 
518 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  46.43 
 
 
511 aa  462  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>