More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1723 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  100 
 
 		 505 aa  1006    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  78.42 
 
 		 505 aa  833    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  76.44 
 
 		 505 aa  790    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  78.22 
 
 		 505 aa  836    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  51.38 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  52.37 
 
 		 516 aa  508  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  50.58 
 
 		 528 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  50.99 
 
 		 510 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  52.23 
 
 		 517 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  52.56 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  51.19 
 
 		 513 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  50.59 
 
 		 510 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.62 
 
 		 510 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  50.98 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  50.58 
 
 		 527 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  50.69 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  50 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  51.39 
 
 		 531 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  50 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  50.2 
 
 		 520 aa  485  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  50.2 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  50.1 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  49.6 
 
 		 510 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  50.89 
 
 		 506 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  49.01 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  48.43 
 
 		 533 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  50.29 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  50.39 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  48.74 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  51.37 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  49.81 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  48.71 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.31 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  48.92 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.17 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  49.3 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  49.8 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  48.34 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  48.92 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  47.24 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  46.65 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  51.48 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  51.2 
 
 		 501 aa  475  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.15 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  51.38 
 
 		 519 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  49.3 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  49.3 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  49.3 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  48.81 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  48.72 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  49.3 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  49.3 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  51.39 
 
 		 501 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  48.72 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  48.51 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.84 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  49.3 
 
 		 515 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  47.05 
 
 		 517 aa  478  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  48.84 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  50 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  48.13 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  49.61 
 
 		 523 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  47.34 
 
 		 517 aa  475  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  48.91 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  48.75 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  48.91 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  48.64 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  47.44 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  48.31 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  47.45 
 
 		 533 aa  472  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  49.41 
 
 		 518 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  46.29 
 
 		 528 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  49.11 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  48.81 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  50.88 
 
 		 517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  45.9 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  46.77 
 
 		 542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  48.02 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  48.91 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  48.02 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  45.96 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  47.96 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  46.77 
 
 		 542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  50.49 
 
 		 517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  49.8 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  47.93 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  47.24 
 
 		 517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  46.39 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  47.49 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  45.31 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  46.27 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  51.37 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  48.94 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  49.71 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  49.02 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  47.56 
 
 		 533 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  49.41 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  49.71 
 
 		 515 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  48.65 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  49.71 
 
 		 527 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>