More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1772 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  100 
 
 
505 aa  1011    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  76.44 
 
 
505 aa  810    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  73.66 
 
 
505 aa  786    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  73.66 
 
 
505 aa  795    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  51.77 
 
 
507 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  50.79 
 
 
516 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  50.89 
 
 
510 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  49.41 
 
 
510 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.72 
 
 
510 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  48.92 
 
 
531 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  50.49 
 
 
507 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  48.72 
 
 
511 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  46.46 
 
 
507 aa  478  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  48.62 
 
 
512 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  50.39 
 
 
516 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  49.41 
 
 
522 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  48.52 
 
 
516 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  48.64 
 
 
528 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  48.42 
 
 
513 aa  475  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  47.57 
 
 
511 aa  477  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  46.11 
 
 
542 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  48.02 
 
 
513 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  47.43 
 
 
510 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  47.34 
 
 
517 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  48.22 
 
 
512 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  48.21 
 
 
506 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  48.22 
 
 
509 aa  472  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  46.46 
 
 
517 aa  473  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  46.85 
 
 
514 aa  474  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  48.62 
 
 
511 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  46.11 
 
 
542 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  48.63 
 
 
513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  46.3 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  48.02 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  48.33 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  48.43 
 
 
518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  47.07 
 
 
537 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  47.34 
 
 
516 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  48.13 
 
 
515 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  48.15 
 
 
520 aa  467  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  46.89 
 
 
575 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  48.02 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  47.14 
 
 
516 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  49.51 
 
 
501 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  47.48 
 
 
513 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  49.7 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  48.62 
 
 
513 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  48.16 
 
 
527 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  46.14 
 
 
513 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  47.38 
 
 
534 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  47.2 
 
 
556 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  48.23 
 
 
515 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  48.33 
 
 
517 aa  463  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  47.14 
 
 
511 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  46.23 
 
 
509 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  46.03 
 
 
509 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  48.62 
 
 
513 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  46.08 
 
 
517 aa  464  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  47.58 
 
 
513 aa  465  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  47.38 
 
 
525 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  48.43 
 
 
515 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  46.98 
 
 
533 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  48.81 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  46.34 
 
 
511 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  46.25 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  47.56 
 
 
526 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  46.64 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  46.51 
 
 
513 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  45.75 
 
 
522 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  47.14 
 
 
513 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  48.03 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  48.15 
 
 
520 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  46.44 
 
 
512 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  47.17 
 
 
520 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  46.25 
 
 
515 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  46.25 
 
 
515 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  46.25 
 
 
512 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  48.16 
 
 
517 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  46.25 
 
 
512 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  47.69 
 
 
539 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  47.56 
 
 
534 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  46.25 
 
 
512 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  45.91 
 
 
575 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  46.44 
 
 
515 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  46.17 
 
 
560 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  45.56 
 
 
513 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  46.27 
 
 
520 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  46.39 
 
 
533 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  46.56 
 
 
533 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  45.49 
 
 
520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  45.51 
 
 
540 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  44.49 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  46.58 
 
 
522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  46.05 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  45.22 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  44.83 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  46.09 
 
 
540 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  47.22 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  46.37 
 
 
560 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  45.22 
 
 
528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>