More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1573 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  100 
 
 
507 aa  1038    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  53.65 
 
 
516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  51.38 
 
 
517 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.86 
 
 
511 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  51.57 
 
 
518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  51.08 
 
 
510 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  51.28 
 
 
516 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  51.28 
 
 
516 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  51.29 
 
 
516 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  50.79 
 
 
515 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  50.3 
 
 
513 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  50.3 
 
 
513 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  51.09 
 
 
511 aa  541  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  51.38 
 
 
514 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  51.28 
 
 
512 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  51.28 
 
 
512 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  51.87 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  51.08 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  51.28 
 
 
515 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.09 
 
 
510 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  49.9 
 
 
522 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  50.2 
 
 
515 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  50.88 
 
 
515 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  51.38 
 
 
511 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  50.89 
 
 
515 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  50.89 
 
 
515 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  50.89 
 
 
515 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  49.61 
 
 
516 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  50.89 
 
 
512 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.88 
 
 
512 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  50.89 
 
 
512 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  51.08 
 
 
512 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  49.41 
 
 
542 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  51.87 
 
 
515 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  48.53 
 
 
518 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  49.8 
 
 
511 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.39 
 
 
510 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  48.32 
 
 
509 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  48.32 
 
 
509 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  50.59 
 
 
511 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  48.83 
 
 
540 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  51.09 
 
 
510 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  50.49 
 
 
528 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  50.69 
 
 
515 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  48.53 
 
 
518 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  48.05 
 
 
542 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  48.14 
 
 
518 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  48.44 
 
 
537 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  50.88 
 
 
513 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  48.34 
 
 
518 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  48.05 
 
 
542 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  50.3 
 
 
506 aa  521  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  49.8 
 
 
513 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  50.29 
 
 
528 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  51.68 
 
 
510 aa  524  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  51.87 
 
 
533 aa  519  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  50.2 
 
 
512 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  51.48 
 
 
531 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  50.69 
 
 
512 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  49.03 
 
 
513 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  48.44 
 
 
575 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  50.1 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  50.1 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  49.9 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  48.32 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  51.08 
 
 
560 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  49.51 
 
 
516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  47.86 
 
 
575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  48.62 
 
 
509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  48.84 
 
 
513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  51.47 
 
 
560 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  49.71 
 
 
528 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  48.45 
 
 
556 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  48.63 
 
 
533 aa  511  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  50.1 
 
 
528 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  51.38 
 
 
505 aa  514  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  50.79 
 
 
505 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  48.92 
 
 
517 aa  510  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  49.32 
 
 
525 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  49.51 
 
 
527 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  48.83 
 
 
511 aa  510  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  49.71 
 
 
526 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  49.22 
 
 
534 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  49.12 
 
 
548 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.9 
 
 
517 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  49.71 
 
 
525 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  49.9 
 
 
528 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  50.29 
 
 
517 aa  509  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  49.51 
 
 
508 aa  509  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  50.5 
 
 
513 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  48.42 
 
 
511 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  50.5 
 
 
513 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  49.51 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  49.32 
 
 
525 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  48.16 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  49.31 
 
 
517 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  48.04 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  48.92 
 
 
510 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  48.04 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  50.68 
 
 
525 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>