35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0398 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  97.62 
 
 
378 aa  764    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  84.66 
 
 
378 aa  675    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  98.15 
 
 
378 aa  767    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  100 
 
 
378 aa  776    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  35.12 
 
 
417 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  37.68 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  36.19 
 
 
367 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  36.19 
 
 
367 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  35.68 
 
 
376 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  33.98 
 
 
370 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  34.96 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  30.7 
 
 
376 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  32.19 
 
 
406 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  30.64 
 
 
402 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  30.14 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  28.64 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  29.3 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  28.11 
 
 
455 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  28.99 
 
 
456 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  27.46 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  26.74 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  34.17 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  23.94 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  24.46 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  32.5 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  28.85 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  27.22 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 
2142 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  28.33 
 
 
291 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  28.33 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  30.58 
 
 
295 aa  46.6  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  31.51 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  27.5 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  32.1 
 
 
377 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>