33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_14951 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  843    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  43.01 
 
 
455 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  42.97 
 
 
460 aa  292  9e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  42.97 
 
 
460 aa  292  9e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  42.05 
 
 
440 aa  286  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  37.88 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  39.75 
 
 
406 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  32.77 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  31.79 
 
 
370 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  31.56 
 
 
378 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  30.64 
 
 
378 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  30.64 
 
 
378 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  30.36 
 
 
378 aa  176  8e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  24.59 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  28.8 
 
 
367 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  28.8 
 
 
367 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  26.26 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  26.33 
 
 
376 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  24.16 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  25.76 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  26.89 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  25.13 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  25.99 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  20.33 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
2142 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  32.69 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  29.2 
 
 
380 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  27.72 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  24.31 
 
 
412 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  26.8 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  26.8 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  28.36 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.35 
 
 
291 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>