31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3933 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  100 
 
 		 417 aa  868    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  35.12 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  34.85 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  34.58 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  35.85 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  33.05 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  31.32 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  32.45 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  32.45 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  32.31 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  30.36 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  27.35 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  25.88 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  27.11 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  27.11 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  26.67 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  26.81 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  24.59 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  27.06 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  24.34 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  30.73 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  24.73 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  23.32 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  27.59 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  22.16 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  25.82 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  25.87 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  19.54 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  23.02 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  24.79 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  22.99 
 
 		 2142 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>