23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_14911 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01081  hypothetical protein  68.94 
 
 
456 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  952    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  61.61 
 
 
460 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  61.61 
 
 
460 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  59.17 
 
 
440 aa  580  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  50.12 
 
 
406 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  43.01 
 
 
402 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  30.05 
 
 
376 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  32.16 
 
 
370 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  29.21 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  28.11 
 
 
378 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  28.11 
 
 
378 aa  143  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  27.84 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  26.81 
 
 
417 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  27.01 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  29.87 
 
 
367 aa  127  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  29.87 
 
 
367 aa  127  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  26.42 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  25.14 
 
 
390 aa  106  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  25.93 
 
 
355 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  25.4 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  30.33 
 
 
368 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  21.8 
 
 
370 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>