37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2382 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  751    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  26.11 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  27.58 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  23.24 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  25.6 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  28.49 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  27.91 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  26.38 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  27.62 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  24.13 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  26.05 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  27.46 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  24.59 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  27.27 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  27.27 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  27.78 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  21.92 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  35.66 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  27.5 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  30.26 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  30.26 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  30.07 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  25.76 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 2142 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  41.57 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  25.58 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  27.98 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  29.73 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  25.82 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  23.08 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0984  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  26.92 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  35.96 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  37.08 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1977  hypothetical protein  21.88 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14911  hypothetical protein  30.33 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.061968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>