18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0546 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 
299 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  77.82 
 
 
296 aa  490  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  77.47 
 
 
296 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  76.45 
 
 
296 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1249  hypothetical protein  52.63 
 
 
302 aa  308  9e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  34.17 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  31.3 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  30.53 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  29.77 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  29.77 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3258  hypothetical protein  26.91 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  29.55 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  28.23 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  25.19 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  29.09 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  24.74 
 
 
527 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  24.24 
 
 
527 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  24.44 
 
 
357 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>