53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2372 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  65.13 
 
 		 368 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  66.77 
 
 		 368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  51.14 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  50.42 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  48.96 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  40.25 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  42.86 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  43.13 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  43.23 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  43.73 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  36.99 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  45.42 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  40.6 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  40.6 
 
 		 334 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  37.69 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  41.81 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  35 
 
 		 326 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  34.69 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  36.36 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  39.22 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  37.93 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  34.24 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  39.29 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  38.89 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  42.38 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.68 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  40.4 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  38.1 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  40.06 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  40.06 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.7 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  37.18 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  34.59 
 
 		 326 aa  176  8e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  36.71 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  37.55 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  39.27 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  36.31 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  34.8 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  34.07 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  34.07 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.07 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  27.45 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  27.4 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  26.32 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  27.03 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.53 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1249  hypothetical protein  29.36 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.24 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  25.49 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  26 
 
 		 484 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  30.08 
 
 		 335 aa  42.7  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>