87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2450 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 		 352 aa  709    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  46.15 
 
 		 327 aa  243  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  38.2 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  36.39 
 
 		 346 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  45.05 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  45.05 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  45.05 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  42.33 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  41.21 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  38.72 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  38.53 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  36.26 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  42.86 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  41.34 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  42.5 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  36.42 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  33.05 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  36.11 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  40.28 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  44.23 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  38.67 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  44.62 
 
 		 334 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  34.49 
 
 		 325 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  42.58 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  39.65 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  39.38 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  41 
 
 		 329 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.35 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  41.98 
 
 		 349 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  41.89 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  41.89 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  36.09 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  36.28 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.07 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  41.67 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.58 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  33.55 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  34.19 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  37.23 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  34.8 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  34.07 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  35.23 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0710  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  33.59 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0766  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  22.56 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0406399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.64 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0345037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.95 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1712  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.82 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00334808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1492  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.47 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2037  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.03 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1753  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.03 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0601571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.38 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.273783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0841  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.53 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0737  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  23.77 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1930  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.13 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000673217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2564  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  25 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1746  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.5 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.68 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3576  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.34 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2272  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  28.78 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.83 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0722  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.89 
 
 		 359 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.161158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1650  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  24.67 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0173174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1750  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.67 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2600  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.12 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1881  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.14 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0690  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  27.78 
 
 		 366 aa  46.2  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.253625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3579  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.15 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.93999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0953  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.06 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  29.92 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4028  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  22.7 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3189  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.82 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.438371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  30.71 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1576  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.27 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1486  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.87 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000391444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1591  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.27 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5118  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  22.57 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  hitchhiker  0.00472186 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1016  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.81 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.243489  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  29.92 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1534  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.27 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0873  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.53 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3037  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0151115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  28.23 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1033  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  28.42 
 
 		 355 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3482  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.18 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0817  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  25.17 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.866621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2136  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.92 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1735  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  26.19 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>