More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6993 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6993  asparagine synthase  100 
 
 		 470 aa  945    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  33.19 
 
 		 558 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  35.21 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  32.89 
 
 		 498 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  31.76 
 
 		 562 aa  190  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  32.12 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  31.26 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  32.05 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  31.12 
 
 		 554 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.12 
 
 		 554 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  31.12 
 
 		 554 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  31.12 
 
 		 554 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  31.12 
 
 		 554 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  31.12 
 
 		 554 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  31.69 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  30.9 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  30.9 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  30.54 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 554 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 554 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  30.9 
 
 		 554 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  31.41 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  31.41 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  31.41 
 
 		 554 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  31.8 
 
 		 554 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  30.77 
 
 		 554 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  30.77 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  30.77 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  30.9 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  30.56 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  30.34 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  31.77 
 
 		 556 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  30.75 
 
 		 555 aa  173  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  30.84 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  30.85 
 
 		 554 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  30.92 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  30.56 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  30.04 
 
 		 553 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  30.98 
 
 		 554 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  30.56 
 
 		 554 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  30.56 
 
 		 554 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  30.17 
 
 		 554 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  30.72 
 
 		 557 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  30.75 
 
 		 555 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  30.84 
 
 		 556 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  30.69 
 
 		 552 aa  166  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  29.91 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  30.33 
 
 		 503 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.77 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  34.25 
 
 		 564 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.89 
 
 		 629 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  29.08 
 
 		 599 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  27.41 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.11 
 
 		 591 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.83 
 
 		 583 aa  160  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.73 
 
 		 595 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.48 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  30.98 
 
 		 563 aa  160  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.79 
 
 		 600 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.23 
 
 		 592 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  28.65 
 
 		 594 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  30.61 
 
 		 563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.25 
 
 		 601 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.25 
 
 		 601 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.25 
 
 		 601 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  28.32 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.84 
 
 		 620 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.42 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.77 
 
 		 593 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  31.45 
 
 		 563 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.7 
 
 		 602 aa  153  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.42 
 
 		 510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.42 
 
 		 510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.42 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.42 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.81 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.22 
 
 		 591 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.89 
 
 		 601 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.27 
 
 		 591 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  28.09 
 
 		 589 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.22 
 
 		 610 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  29.4 
 
 		 594 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.25 
 
 		 510 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.25 
 
 		 510 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2891  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.5 
 
 		 618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.16 
 
 		 631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  28.77 
 
 		 569 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  29.45 
 
 		 590 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  31.35 
 
 		 596 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  27.74 
 
 		 589 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.07 
 
 		 594 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.24 
 
 		 590 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.78 
 
 		 590 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.3 
 
 		 594 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  31.25 
 
 		 638 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>