More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2794 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  822    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  68.77 
 
 		 554 aa  822    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  825    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  68.48 
 
 		 556 aa  826    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  66.43 
 
 		 554 aa  796    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  100 
 
 		 554 aa  1159    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  71.12 
 
 		 554 aa  835    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  68.59 
 
 		 554 aa  823    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  68.59 
 
 		 554 aa  808    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  67.51 
 
 		 554 aa  813    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  68.59 
 
 		 554 aa  822    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  68.59 
 
 		 554 aa  822    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  67.87 
 
 		 554 aa  815    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  68.77 
 
 		 554 aa  822    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  62.7 
 
 		 558 aa  742    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  70.58 
 
 		 554 aa  832    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  67.69 
 
 		 554 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  67.51 
 
 		 554 aa  812    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  70.58 
 
 		 554 aa  832    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  70.94 
 
 		 553 aa  836    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  58.29 
 
 		 563 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  70.58 
 
 		 554 aa  832    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  60.65 
 
 		 562 aa  748    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  67.87 
 
 		 554 aa  812    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  68.41 
 
 		 554 aa  818    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  822    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  70.4 
 
 		 552 aa  836    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  59.18 
 
 		 563 aa  687    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  66.61 
 
 		 555 aa  800    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  59.18 
 
 		 563 aa  687    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 555 aa  813    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  822    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  70.94 
 
 		 554 aa  835    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  71.12 
 
 		 554 aa  845    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  70.99 
 
 		 556 aa  858    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  822    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  68.23 
 
 		 554 aa  817    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  71.3 
 
 		 554 aa  841    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  71.48 
 
 		 554 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  70.22 
 
 		 554 aa  824    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  70.56 
 
 		 557 aa  836    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  59.18 
 
 		 564 aa  686    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  67.69 
 
 		 554 aa  812    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  71.12 
 
 		 554 aa  838    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  69.86 
 
 		 554 aa  822    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  71.3 
 
 		 556 aa  845    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  67.69 
 
 		 554 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  68.77 
 
 		 554 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  70.58 
 
 		 554 aa  832    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  51.88 
 
 		 596 aa  601  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  48.89 
 
 		 571 aa  567  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  48.91 
 
 		 592 aa  561  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  48.7 
 
 		 573 aa  524  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  45.11 
 
 		 638 aa  478  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  44.53 
 
 		 537 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  39.17 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.19 
 
 		 528 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  39.48 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  39.43 
 
 		 530 aa  300  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  36.61 
 
 		 537 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.61 
 
 		 498 aa  287  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  37.83 
 
 		 498 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.28 
 
 		 512 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  31.61 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.91 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  30.74 
 
 		 482 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.65 
 
 		 606 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.21 
 
 		 536 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.24 
 
 		 592 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.08 
 
 		 660 aa  191  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.58 
 
 		 660 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.19 
 
 		 635 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.93 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.22 
 
 		 632 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.44 
 
 		 633 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.71 
 
 		 605 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.44 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  31.44 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  31.44 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.44 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.44 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.44 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.44 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.09 
 
 		 621 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0140  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.58 
 
 		 614 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0103295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6993  asparagine synthase  32.05 
 
 		 470 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1597  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.17 
 
 		 640 aa  182  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.2 
 
 		 624 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.65 
 
 		 666 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>