More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1280 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  62.19 
 
 		 554 aa  722    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  60.43 
 
 		 554 aa  694    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.43 
 
 		 554 aa  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  62.01 
 
 		 554 aa  718    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  61.68 
 
 		 554 aa  710    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  62.01 
 
 		 554 aa  718    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  58.29 
 
 		 554 aa  700    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  62.01 
 
 		 554 aa  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  59.89 
 
 		 554 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  62.01 
 
 		 554 aa  718    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  60.43 
 
 		 554 aa  694    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  100 
 
 		 563 aa  1147    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  60.07 
 
 		 554 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  59.71 
 
 		 554 aa  675    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  59.89 
 
 		 554 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  60.78 
 
 		 554 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  60.78 
 
 		 554 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  59.89 
 
 		 554 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  61.83 
 
 		 554 aa  716    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  79.4 
 
 		 563 aa  905    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  60.25 
 
 		 553 aa  711    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  59.54 
 
 		 554 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  57.32 
 
 		 556 aa  681    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  59.71 
 
 		 554 aa  689    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  60.43 
 
 		 554 aa  694    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  59.4 
 
 		 557 aa  702    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  55.26 
 
 		 562 aa  666    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  60.43 
 
 		 554 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  61.85 
 
 		 554 aa  731    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  59.89 
 
 		 554 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  61.47 
 
 		 555 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  59.89 
 
 		 554 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  59.54 
 
 		 554 aa  690    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  82.06 
 
 		 564 aa  919    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  59.54 
 
 		 554 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  61.14 
 
 		 554 aa  699    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  59.5 
 
 		 556 aa  702    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  61.68 
 
 		 554 aa  715    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  62.19 
 
 		 554 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  62.19 
 
 		 554 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  60.43 
 
 		 554 aa  694    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  79.22 
 
 		 563 aa  903    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  61.14 
 
 		 554 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  56.68 
 
 		 558 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  60.25 
 
 		 554 aa  692    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  60.96 
 
 		 554 aa  711    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  60.25 
 
 		 554 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  62.19 
 
 		 554 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  63.1 
 
 		 554 aa  734    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  59.86 
 
 		 555 aa  704    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  59.18 
 
 		 556 aa  695    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  59.54 
 
 		 554 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  62.21 
 
 		 552 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  55.35 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  50.5 
 
 		 592 aa  568  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  48.63 
 
 		 571 aa  541  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  47.72 
 
 		 573 aa  527  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  45.81 
 
 		 638 aa  473  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  43.58 
 
 		 537 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  41.46 
 
 		 543 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  37.96 
 
 		 503 aa  332  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.81 
 
 		 528 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  37.88 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  38.26 
 
 		 530 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  36.78 
 
 		 498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38 
 
 		 512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.62 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  29.37 
 
 		 484 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  29.1 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  30.21 
 
 		 482 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.01 
 
 		 510 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.01 
 
 		 510 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.01 
 
 		 510 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.01 
 
 		 510 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.01 
 
 		 510 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.01 
 
 		 510 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.3 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 		 592 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.6 
 
 		 536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.41 
 
 		 646 aa  189  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.07 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.42 
 
 		 678 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  30.56 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.29 
 
 		 610 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.65 
 
 		 666 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.64 
 
 		 664 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.91 
 
 		 632 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.32 
 
 		 660 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.32 
 
 		 660 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.64 
 
 		 678 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  31.24 
 
 		 599 aa  173  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.64 
 
 		 678 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  31.2 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.96 
 
 		 617 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.11 
 
 		 595 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.87 
 
 		 590 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0872  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.22 
 
 		 618 aa  171  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0025755  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.43 
 
 		 627 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.89 
 
 		 666 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.34 
 
 		 635 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>