More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18337 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  100 
 
 
596 aa  1239    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  55.13 
 
 
556 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  55.92 
 
 
556 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  52.91 
 
 
554 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  52.36 
 
 
558 aa  613  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  52.74 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  53.42 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  52.71 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  53.25 
 
 
554 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  52.65 
 
 
554 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.97 
 
 
554 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  51.88 
 
 
554 aa  601  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  52.74 
 
 
554 aa  598  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  52.57 
 
 
554 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  52.91 
 
 
552 aa  599  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  52.4 
 
 
554 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  601  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  601  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  52.31 
 
 
554 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  51.97 
 
 
554 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  52.4 
 
 
554 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  52.31 
 
 
554 aa  601  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  51.28 
 
 
554 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  52.9 
 
 
554 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  51.79 
 
 
554 aa  598  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  51.28 
 
 
554 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  52.57 
 
 
554 aa  595  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  51.28 
 
 
554 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  51.71 
 
 
555 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  51.28 
 
 
554 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  51.28 
 
 
554 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  52.23 
 
 
554 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  52.05 
 
 
554 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  52.05 
 
 
554 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  52.05 
 
 
554 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  52.57 
 
 
555 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  52.91 
 
 
554 aa  594  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  591  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  51.54 
 
 
554 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  51.62 
 
 
554 aa  591  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  52.05 
 
 
554 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  54.42 
 
 
564 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  51.97 
 
 
554 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  53.91 
 
 
563 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  53.74 
 
 
563 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  50.68 
 
 
556 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  55.18 
 
 
563 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.613021 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  47.63 
 
 
571 aa  551  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  48.37 
 
 
592 aa  543  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  46.95 
 
 
573 aa  530  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  47.64 
 
 
638 aa  489  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  41.36 
 
 
537 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  38.5 
 
 
543 aa  361  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.66 
 
 
528 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  37.13 
 
 
530 aa  303  8.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  34.84 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  35.55 
 
 
498 aa  271  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  34.94 
 
 
537 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  35.76 
 
 
498 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.27 
 
 
512 aa  257  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
510 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
510 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
510 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
510 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
510 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
510 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
510 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.16 
 
 
536 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.74 
 
 
484 aa  187  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  28.26 
 
 
492 aa  183  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.33 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.25 
 
 
660 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.42 
 
 
660 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.45 
 
 
554 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.09 
 
 
639 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.68 
 
 
633 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  29.93 
 
 
482 aa  171  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  30.23 
 
 
606 aa  170  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.95 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  31.95 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  31.95 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.95 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.95 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.95 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.95 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.95 
 
 
633 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.69 
 
 
514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.79 
 
 
678 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.6 
 
 
605 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.23 
 
 
600 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3049  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.17 
 
 
643 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.524302  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.22 
 
 
633 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.11 
 
 
624 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>