More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2386 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 554 aa  1117    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  31.93 
 
 		 503 aa  241  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.88 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  33.13 
 
 		 488 aa  237  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.42 
 
 		 513 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.91 
 
 		 513 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.71 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.02 
 
 		 514 aa  217  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  32.39 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  33.13 
 
 		 498 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  29.9 
 
 		 537 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  32.17 
 
 		 498 aa  183  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  31.92 
 
 		 563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  31.92 
 
 		 563 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  30.94 
 
 		 564 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.62 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  32.87 
 
 		 563 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  29.45 
 
 		 596 aa  173  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  28.24 
 
 		 556 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  28.4 
 
 		 553 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  29.27 
 
 		 554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  29.33 
 
 		 554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  29.18 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  29.59 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  29.04 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  29.33 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  29.12 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  28.85 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  29.18 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  29.18 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  29.39 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  29.18 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  29.27 
 
 		 554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  29.27 
 
 		 554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  29.27 
 
 		 554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  29.27 
 
 		 554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  29.27 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.27 
 
 		 554 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  29.27 
 
 		 554 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  27.69 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  29.08 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  29.06 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  28.78 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  28.77 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  29.59 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  28.51 
 
 		 552 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  29.62 
 
 		 554 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  28.37 
 
 		 558 aa  163  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  28.32 
 
 		 556 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.41 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  28.06 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  28.71 
 
 		 555 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  29.54 
 
 		 573 aa  160  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  29.05 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  28.29 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  29.21 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  28.68 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  32.05 
 
 		 638 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.07 
 
 		 666 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  27.9 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  27.9 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  27.9 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  28.35 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  29.02 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  27.9 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  27.9 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  27.7 
 
 		 554 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  30.71 
 
 		 594 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  29.12 
 
 		 530 aa  153  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.14 
 
 		 592 aa  153  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  27.7 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  27.7 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  29.37 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.83 
 
 		 635 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.1 
 
 		 664 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.31 
 
 		 528 aa  150  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  28.19 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  26.84 
 
 		 571 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  28.49 
 
 		 554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  28.21 
 
 		 590 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0200  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.64 
 
 		 655 aa  144  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.95 
 
 		 633 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.98 
 
 		 678 aa  143  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1597  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.68 
 
 		 640 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.65 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.85 
 
 		 583 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1938  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.18 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.83 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.36 
 
 		 589 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.37 
 
 		 660 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.12 
 
 		 633 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.83 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>