More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2252 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  100 
 
 
537 aa  1112    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  45.39 
 
 
556 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  44.77 
 
 
592 aa  481  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  45.07 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  44.77 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  46.27 
 
 
554 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  46.27 
 
 
554 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  44.3 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  46.27 
 
 
554 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  44.76 
 
 
573 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  46.46 
 
 
554 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  46.08 
 
 
554 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  45.13 
 
 
555 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  45.35 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  43.81 
 
 
557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  44.38 
 
 
552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  44.76 
 
 
554 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  44.76 
 
 
554 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  41.36 
 
 
596 aa  449  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  43.3 
 
 
554 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.57 
 
 
554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  44.76 
 
 
554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  44.76 
 
 
554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  44.96 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  44.57 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  44.67 
 
 
554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  44.76 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  44.38 
 
 
554 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  43.35 
 
 
554 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  43.53 
 
 
554 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
554 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  44.96 
 
 
554 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  43.58 
 
 
558 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  44.96 
 
 
554 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  42.93 
 
 
554 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  43.17 
 
 
554 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  44.53 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  42.5 
 
 
562 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  43.17 
 
 
554 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  44.38 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  42.16 
 
 
555 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  43.83 
 
 
556 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  42.91 
 
 
554 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  43.35 
 
 
554 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  42.91 
 
 
554 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  42.91 
 
 
554 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  43.21 
 
 
554 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  43.21 
 
 
554 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  42.19 
 
 
554 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  44.88 
 
 
563 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  44.69 
 
 
563 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  44.55 
 
 
563 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  42.07 
 
 
564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  43.21 
 
 
638 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  39.81 
 
 
543 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.47 
 
 
528 aa  346  7e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  39.26 
 
 
537 aa  336  7e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  40.51 
 
 
530 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  39.96 
 
 
503 aa  324  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.82 
 
 
498 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  36.63 
 
 
498 aa  286  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.04 
 
 
512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  32.69 
 
 
482 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  30.64 
 
 
492 aa  243  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.83 
 
 
484 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.45 
 
 
626 aa  204  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.46 
 
 
660 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.94 
 
 
660 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  31.39 
 
 
488 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.69 
 
 
678 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 
664 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.29 
 
 
536 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.4 
 
 
583 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.9 
 
 
554 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.72 
 
 
530 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.87 
 
 
592 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
510 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
510 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
510 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.21 
 
 
514 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
510 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
510 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
510 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
510 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.05 
 
 
678 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.05 
 
 
678 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.56 
 
 
666 aa  180  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.5 
 
 
634 aa  179  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.16 
 
 
632 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.47 
 
 
646 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2789  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.33 
 
 
670 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.78 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.28 
 
 
655 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.6 
 
 
607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1617  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.03 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>