More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2767 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  70.76 
 
 		 554 aa  844    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  68.59 
 
 		 555 aa  823    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  62.01 
 
 		 563 aa  679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  821    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  71.12 
 
 		 554 aa  835    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  100 
 
 		 554 aa  1149    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  95.13 
 
 		 554 aa  1099    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  95.31 
 
 		 554 aa  1101    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  62.54 
 
 		 563 aa  710    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  88.15 
 
 		 557 aa  1035    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  70.94 
 
 		 554 aa  844    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  90.07 
 
 		 552 aa  1044    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  88.81 
 
 		 554 aa  1037    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  62.19 
 
 		 563 aa  706    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  89.17 
 
 		 553 aa  1035    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  71.66 
 
 		 554 aa  838    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  96.03 
 
 		 554 aa  1108    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  71.48 
 
 		 554 aa  820    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  69.86 
 
 		 554 aa  819    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  71.66 
 
 		 554 aa  839    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  821    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  61 
 
 		 564 aa  693    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  88.09 
 
 		 555 aa  1025    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  70.04 
 
 		 554 aa  830    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  66.97 
 
 		 556 aa  805    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  95.49 
 
 		 554 aa  1102    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  71.12 
 
 		 554 aa  837    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  66.85 
 
 		 558 aa  784    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  68.12 
 
 		 556 aa  816    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  69.86 
 
 		 554 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  97.29 
 
 		 554 aa  1119    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  97.11 
 
 		 554 aa  1118    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  87.18 
 
 		 554 aa  1021    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  69.86 
 
 		 554 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  69.86 
 
 		 554 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  97.47 
 
 		 554 aa  1122    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  87.36 
 
 		 554 aa  1017    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  73.1 
 
 		 556 aa  851    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  71.84 
 
 		 554 aa  838    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  840    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  95.49 
 
 		 554 aa  1102    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  65.52 
 
 		 562 aa  778    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  70.76 
 
 		 554 aa  835    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  52.05 
 
 		 596 aa  594  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  51.25 
 
 		 592 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  49.4 
 
 		 571 aa  555  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  52.06 
 
 		 573 aa  535  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  47.95 
 
 		 638 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  45.35 
 
 		 537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  42.86 
 
 		 543 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  39.37 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.55 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  39.48 
 
 		 530 aa  300  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  38.72 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.62 
 
 		 498 aa  291  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  36.97 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.88 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.02 
 
 		 510 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  31.98 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  30.54 
 
 		 492 aa  220  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.25 
 
 		 484 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.57 
 
 		 624 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.82 
 
 		 592 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.24 
 
 		 678 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.5 
 
 		 660 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.5 
 
 		 660 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.66 
 
 		 666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  30.64 
 
 		 592 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.82 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  29.25 
 
 		 599 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.26 
 
 		 607 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.63 
 
 		 633 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.91 
 
 		 664 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.36 
 
 		 633 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.34 
 
 		 658 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.67 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>