More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0725 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.38 
 
 		 530 aa  634    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  93.76 
 
 		 513 aa  983    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 513 aa  1038    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  68.09 
 
 		 514 aa  733    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  95.32 
 
 		 513 aa  994    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  34.4 
 
 		 488 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  34.27 
 
 		 503 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.71 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.46 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  31.9 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.69 
 
 		 536 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  31.27 
 
 		 498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  28.77 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  28.57 
 
 		 554 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  28.6 
 
 		 557 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  29.81 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  29.53 
 
 		 554 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  28.37 
 
 		 552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  183  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  28.91 
 
 		 554 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.91 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  28.43 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  28.17 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  28.17 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  29.5 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  29.31 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  27.98 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  27.98 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  28.71 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  27.98 
 
 		 554 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  34.11 
 
 		 468 aa  180  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  28.52 
 
 		 554 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  27.65 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  29.11 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  29.28 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  30.5 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  29.11 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  27.98 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  27.98 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  27.98 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  28.18 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  27.98 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  28.37 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 		 510 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 		 510 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  28.91 
 
 		 555 aa  176  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.8 
 
 		 510 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  29.77 
 
 		 537 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  27.78 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  26.67 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  27.79 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  27.79 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  27.92 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.78 
 
 		 624 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  27.79 
 
 		 554 aa  174  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  30.56 
 
 		 537 aa  173  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  29.31 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.71 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  28.21 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.66 
 
 		 619 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  28.38 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.02 
 
 		 660 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.25 
 
 		 628 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.78 
 
 		 660 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.3 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.43 
 
 		 621 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.85 
 
 		 598 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  27.22 
 
 		 556 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.83 
 
 		 678 aa  159  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  28.46 
 
 		 571 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  27.64 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.79 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.32 
 
 		 590 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.73 
 
 		 678 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.49 
 
 		 591 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  27.95 
 
 		 573 aa  157  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  25.9 
 
 		 589 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  25.71 
 
 		 589 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.98 
 
 		 632 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.39 
 
 		 595 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.17 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.57 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.92 
 
 		 678 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  26.75 
 
 		 589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.07 
 
 		 658 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  26.33 
 
 		 589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.11 
 
 		 632 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>