More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2469 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.21 
 
 		 593 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  55.87 
 
 		 595 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  61.08 
 
 		 589 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  60.07 
 
 		 589 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.05 
 
 		 594 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.51 
 
 		 589 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  64.81 
 
 		 590 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  55.33 
 
 		 590 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  61.72 
 
 		 599 aa  740    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.42 
 
 		 601 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  60.58 
 
 		 589 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  78.95 
 
 		 600 aa  973    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  55.33 
 
 		 590 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  65.26 
 
 		 593 aa  775    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  56.18 
 
 		 590 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  78.34 
 
 		 591 aa  968    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  55.7 
 
 		 595 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  59.56 
 
 		 594 aa  720    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.39 
 
 		 594 aa  744    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  60.37 
 
 		 592 aa  746    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  65.14 
 
 		 590 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.18 
 
 		 589 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  67.17 
 
 		 591 aa  806    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  60.24 
 
 		 589 aa  726    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2910  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  62.39 
 
 		 594 aa  742    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  56.3 
 
 		 595 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.31 
 
 		 590 aa  800    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.69 
 
 		 596 aa  754    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.61 
 
 		 593 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.42 
 
 		 601 aa  765    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  63.42 
 
 		 601 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 591 aa  1206    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  55.2 
 
 		 595 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.37 
 
 		 595 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.23 
 
 		 593 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.75 
 
 		 601 aa  751    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.77 
 
 		 598 aa  739    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.54 
 
 		 621 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  58.77 
 
 		 569 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.42 
 
 		 601 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.71 
 
 		 594 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  55.57 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  55.16 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  55.16 
 
 		 589 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.5 
 
 		 610 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  53.78 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  51.96 
 
 		 598 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  51 
 
 		 602 aa  596  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.58 
 
 		 590 aa  598  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  51.92 
 
 		 592 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  35.07 
 
 		 643 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.84 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.06 
 
 		 638 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.74 
 
 		 632 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.27 
 
 		 658 aa  299  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.8 
 
 		 639 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.49 
 
 		 619 aa  297  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  31.63 
 
 		 632 aa  296  6e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.94 
 
 		 628 aa  296  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 		 635 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  31.47 
 
 		 632 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.59 
 
 		 646 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 		 610 aa  294  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.51 
 
 		 643 aa  293  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  31.09 
 
 		 637 aa  293  7e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.27 
 
 		 629 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1548  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.44 
 
 		 647 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.76 
 
 		 632 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  33.83 
 
 		 656 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.94 
 
 		 637 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.71 
 
 		 635 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.84 
 
 		 632 aa  286  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.23 
 
 		 649 aa  286  9e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.59 
 
 		 637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4592  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 		 645 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.65001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.13 
 
 		 629 aa  283  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.49 
 
 		 643 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.43 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.72 
 
 		 633 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.35 
 
 		 592 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.03 
 
 		 635 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.27 
 
 		 633 aa  280  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.22 
 
 		 641 aa  279  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.97 
 
 		 634 aa  279  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.2 
 
 		 630 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.95 
 
 		 678 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33 
 
 		 605 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.95 
 
 		 678 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0358  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.07 
 
 		 697 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.395531 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.16 
 
 		 623 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.8 
 
 		 649 aa  273  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.91 
 
 		 633 aa  273  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.57 
 
 		 633 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>