63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3219 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 		 333 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  57.44 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  52.4 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  52.25 
 
 		 334 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  51.5 
 
 		 334 aa  352  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  51.5 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  43.6 
 
 		 329 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  42.32 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  40.65 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  42.22 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  38.18 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  43.79 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  41.82 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  38.18 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  44.3 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  38.29 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  40.51 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  39.39 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  43.81 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  43.48 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  39.35 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  43.17 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  43.17 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  40.73 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  39.74 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  42.36 
 
 		 329 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  43.54 
 
 		 349 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.56 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  38.67 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  45.42 
 
 		 357 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  39.94 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  43.8 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.13 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.06 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.74 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  39.74 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  38.63 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  39.53 
 
 		 357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  39.38 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  34.02 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  27.01 
 
 		 212 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2244  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.08 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2564  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  33.82 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.15702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.77 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.58 
 
 		 413 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.89 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0766  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.95 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0406399  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.15 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  27.33 
 
 		 484 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1976  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.51 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.41 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  28.3 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.33 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.06 
 
 		 484 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.06 
 
 		 484 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  25.68 
 
 		 484 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3073  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  34.35 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.78 
 
 		 392 aa  42.7  0.008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  24.37 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.67 
 
 		 429 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.45 
 
 		 484 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>