154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3122 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  75.54 
 
 
422 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 
429 aa  867    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  66.17 
 
 
414 aa  544  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  62.78 
 
 
400 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  60.78 
 
 
398 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.72 
 
 
393 aa  351  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.8 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.75 
 
 
392 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  36 
 
 
380 aa  253  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.81 
 
 
392 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.06 
 
 
392 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.63 
 
 
400 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.82 
 
 
401 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.08 
 
 
402 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.19 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.39 
 
 
407 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.39 
 
 
407 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.16 
 
 
405 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.5 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.44 
 
 
414 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.47 
 
 
385 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.79 
 
 
420 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.6 
 
 
389 aa  230  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.21 
 
 
385 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.51 
 
 
407 aa  229  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.24 
 
 
410 aa  229  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.22 
 
 
404 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.23 
 
 
389 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.73 
 
 
401 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2568  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.37 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.3 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.54 
 
 
396 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  32.36 
 
 
400 aa  218  2e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.38 
 
 
388 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1035  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.46 
 
 
422 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.533687  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.68 
 
 
395 aa  210  3e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.29 
 
 
391 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.39 
 
 
392 aa  207  4e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.15 
 
 
403 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.41 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.15 
 
 
404 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.15 
 
 
404 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 
404 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 
404 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 
403 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.42 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000116963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0925  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.37 
 
 
387 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000171827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.7 
 
 
394 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.44 
 
 
398 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.15 
 
 
392 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000028573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.15 
 
 
392 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000522414  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.25 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  34.92 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.92 
 
 
383 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.55 
 
 
385 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.92 
 
 
383 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.23 
 
 
385 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.32 
 
 
383 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.35 
 
 
376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.42 
 
 
484 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.18 
 
 
370 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.17 
 
 
493 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 
472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  30.05 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  36.91 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.58 
 
 
474 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  37.4 
 
 
502 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  37.02 
 
 
392 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.53 
 
 
392 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  35.82 
 
 
369 aa  156  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.29 
 
 
371 aa  153  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.99 
 
 
484 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  31.28 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.91 
 
 
361 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.56 
 
 
485 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.71 
 
 
484 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.71 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.69 
 
 
484 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  41.54 
 
 
213 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.08 
 
 
484 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.99 
 
 
484 aa  146  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.37 
 
 
482 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.61 
 
 
473 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 
484 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.6 
 
 
500 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  34.19 
 
 
392 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.9 
 
 
484 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.54 
 
 
416 aa  144  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.43 
 
 
484 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.43 
 
 
484 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>