158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2184 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 
369 aa  765    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  52.23 
 
 
370 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  47.35 
 
 
361 aa  363  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  36.9 
 
 
436 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.63 
 
 
416 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.66 
 
 
484 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  36.83 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.51 
 
 
380 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.72 
 
 
371 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.38 
 
 
392 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  36.61 
 
 
404 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.79 
 
 
472 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.14 
 
 
390 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.12 
 
 
392 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 
474 aa  204  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.07 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.33 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.56 
 
 
389 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.01 
 
 
392 aa  195  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  37.46 
 
 
309 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.26 
 
 
392 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  35.22 
 
 
392 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.25 
 
 
475 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.6 
 
 
383 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.29 
 
 
473 aa  188  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.07 
 
 
398 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.34 
 
 
385 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.89 
 
 
383 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.14 
 
 
381 aa  186  8e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.16 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.48 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.46 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.96 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.45 
 
 
401 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.29 
 
 
406 aa  182  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.18 
 
 
400 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.89 
 
 
404 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.89 
 
 
403 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.89 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.89 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.63 
 
 
404 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.63 
 
 
404 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 
407 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 
407 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.42 
 
 
404 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.63 
 
 
404 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.87 
 
 
385 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  34.67 
 
 
335 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  33.6 
 
 
392 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.89 
 
 
403 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.19 
 
 
402 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.77 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  33.69 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.97 
 
 
414 aa  173  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.67 
 
 
404 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.61 
 
 
422 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.25 
 
 
483 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.47 
 
 
413 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.08 
 
 
398 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  35.76 
 
 
502 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.88 
 
 
500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.07 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.16 
 
 
420 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.02 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.95 
 
 
407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.65 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.07 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.39 
 
 
410 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  30.89 
 
 
407 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.83 
 
 
385 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.94 
 
 
484 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
482 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.74 
 
 
484 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.74 
 
 
484 aa  159  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.49 
 
 
484 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.23 
 
 
483 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.65 
 
 
484 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.97 
 
 
493 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.59 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.82 
 
 
429 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.8 
 
 
482 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.8 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  30.03 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.8 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.8 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  28.8 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.8 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.71 
 
 
484 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.93 
 
 
484 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.53 
 
 
482 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.53 
 
 
482 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.53 
 
 
482 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.79 
 
 
484 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.79 
 
 
484 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.25 
 
 
484 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.91 
 
 
388 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.23 
 
 
484 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.5 
 
 
482 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.5 
 
 
482 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>