150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf098 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
381 aa  780    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.95 
 
 
402 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.07 
 
 
401 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.82 
 
 
407 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.82 
 
 
407 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.08 
 
 
390 aa  255  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.5 
 
 
405 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  39.62 
 
 
400 aa  250  3e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.03 
 
 
392 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.75 
 
 
407 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.56 
 
 
403 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.95 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.95 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.68 
 
 
404 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.68 
 
 
403 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.68 
 
 
404 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.68 
 
 
404 aa  245  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.68 
 
 
404 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.86 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.18 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.42 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.33 
 
 
380 aa  242  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.17 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 
389 aa  242  9e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.94 
 
 
394 aa  241  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.22 
 
 
392 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.24 
 
 
391 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.6 
 
 
389 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.63 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.81 
 
 
400 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.92 
 
 
392 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.68 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.02 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.34 
 
 
413 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.31 
 
 
395 aa  230  3e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.95 
 
 
406 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000116963  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.88 
 
 
392 aa  224  2e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.11 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.4 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.48 
 
 
388 aa  212  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.84 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.25 
 
 
385 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.97 
 
 
385 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.15 
 
 
405 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.48 
 
 
414 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.37 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.83 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.17 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.22 
 
 
422 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.62 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.25 
 
 
393 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.66 
 
 
392 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000028573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.66 
 
 
392 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000522414  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.66 
 
 
414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0925  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.06 
 
 
387 aa  189  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000171827  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.55 
 
 
385 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.25 
 
 
383 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.71 
 
 
383 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  32.14 
 
 
369 aa  186  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2568  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.6 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.71 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.99 
 
 
406 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.86 
 
 
370 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.51 
 
 
376 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  34.02 
 
 
436 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  34.82 
 
 
335 aa  176  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.94 
 
 
484 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  30.56 
 
 
392 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  29.41 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.12 
 
 
371 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.49 
 
 
361 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.18 
 
 
474 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.03 
 
 
500 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1035  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.26 
 
 
422 aa  159  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.533687  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.37 
 
 
416 aa  159  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.2 
 
 
472 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  28.79 
 
 
404 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  28.16 
 
 
387 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  29.07 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  27.93 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.45 
 
 
484 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  28.06 
 
 
395 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  31.01 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.16 
 
 
475 aa  133  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.79 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.79 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.64 
 
 
473 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.42 
 
 
484 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.1 
 
 
483 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.1 
 
 
483 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.1 
 
 
483 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  27.76 
 
 
493 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.36 
 
 
482 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.67 
 
 
484 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.1 
 
 
482 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.1 
 
 
482 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.19 
 
 
482 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.19 
 
 
482 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.1 
 
 
482 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.1 
 
 
482 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>