153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1402 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.22 
 
 
385 aa  783    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
385 aa  789    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  49.1 
 
 
392 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  48.33 
 
 
392 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  46.65 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.29 
 
 
380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44.9 
 
 
391 aa  325  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.49 
 
 
401 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44.13 
 
 
388 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.24 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.45 
 
 
402 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.18 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.19 
 
 
404 aa  301  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.93 
 
 
404 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.93 
 
 
404 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.93 
 
 
403 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.93 
 
 
404 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.67 
 
 
404 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.67 
 
 
404 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.15 
 
 
404 aa  299  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.67 
 
 
404 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.89 
 
 
403 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.89 
 
 
403 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.57 
 
 
406 aa  290  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000116963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.7 
 
 
413 aa  289  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.17 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.6 
 
 
407 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.6 
 
 
407 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0925  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.19 
 
 
387 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000171827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.95 
 
 
394 aa  275  7e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.31 
 
 
407 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.06 
 
 
405 aa  271  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  40.62 
 
 
400 aa  267  2e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.85 
 
 
407 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.57 
 
 
401 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.57 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.47 
 
 
389 aa  253  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.87 
 
 
392 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000028573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.87 
 
 
392 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000522414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2568  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.44 
 
 
387 aa  247  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.57 
 
 
389 aa  245  9e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.01 
 
 
400 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.92 
 
 
392 aa  237  2e-61  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.26 
 
 
398 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.9 
 
 
422 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.55 
 
 
395 aa  236  4e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.2 
 
 
414 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.85 
 
 
429 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.11 
 
 
398 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.67 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.48 
 
 
414 aa  208  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.68 
 
 
420 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.97 
 
 
381 aa  206  4e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.67 
 
 
393 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  32.9 
 
 
436 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.26 
 
 
385 aa  186  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.32 
 
 
405 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.58 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.59 
 
 
410 aa  182  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1035  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.41 
 
 
422 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.533687  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.01 
 
 
383 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.01 
 
 
383 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.27 
 
 
484 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.34 
 
 
406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.29 
 
 
376 aa  168  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.66 
 
 
484 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  31.02 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.75 
 
 
484 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  32 
 
 
484 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.67 
 
 
484 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.75 
 
 
484 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.83 
 
 
484 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  44.12 
 
 
212 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  30.53 
 
 
404 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  44.78 
 
 
213 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.29 
 
 
370 aa  156  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.12 
 
 
484 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.11 
 
 
484 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.88 
 
 
484 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.88 
 
 
484 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
485 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.9 
 
 
484 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.61 
 
 
484 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.6 
 
 
361 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.83 
 
 
484 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.65 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.67 
 
 
484 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.67 
 
 
484 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.61 
 
 
484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  29.4 
 
 
484 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  31.64 
 
 
392 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.02 
 
 
500 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.52 
 
 
392 aa  150  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.52 
 
 
486 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
484 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
484 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
484 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
484 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.77 
 
 
484 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>