163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1280 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 
482 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  63.22 
 
 
484 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  94.42 
 
 
484 aa  949    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.72 
 
 
486 aa  825    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 
482 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 
482 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  94.42 
 
 
484 aa  945    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  94.21 
 
 
484 aa  944    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  83.06 
 
 
484 aa  843    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 
482 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  94.42 
 
 
484 aa  946    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.44 
 
 
484 aa  838    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  79.96 
 
 
484 aa  834    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  62.19 
 
 
484 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.74 
 
 
482 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  95.25 
 
 
484 aa  966    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  80.58 
 
 
485 aa  831    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
484 aa  998    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 
482 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  95.25 
 
 
484 aa  966    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  62.19 
 
 
482 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  95.25 
 
 
484 aa  966    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.4 
 
 
483 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 
482 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  80.37 
 
 
484 aa  842    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.52 
 
 
482 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.02 
 
 
484 aa  846    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  95.25 
 
 
484 aa  966    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.4 
 
 
483 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.4 
 
 
483 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.98 
 
 
482 aa  634  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.44 
 
 
482 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 
482 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  61.78 
 
 
482 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  61.36 
 
 
482 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 
482 aa  624  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.78 
 
 
482 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 
482 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 
515 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 
482 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.28 
 
 
482 aa  621  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 
482 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  58 
 
 
484 aa  587  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  58.64 
 
 
482 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.46 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.03 
 
 
515 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  53.93 
 
 
483 aa  551  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.38 
 
 
484 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.59 
 
 
484 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.59 
 
 
484 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 
484 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 
484 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.59 
 
 
484 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.17 
 
 
484 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.15 
 
 
484 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.73 
 
 
484 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  47.31 
 
 
484 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.07 
 
 
483 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.49 
 
 
484 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.42 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.74 
 
 
496 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.32 
 
 
484 aa  295  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.31 
 
 
493 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.97 
 
 
500 aa  256  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  32.64 
 
 
502 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.16 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.58 
 
 
474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.34 
 
 
472 aa  189  7e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.24 
 
 
371 aa  186  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.84 
 
 
473 aa  181  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.04 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.33 
 
 
398 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.5 
 
 
400 aa  163  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.11 
 
 
380 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.56 
 
 
370 aa  161  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.59 
 
 
475 aa  157  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.9 
 
 
406 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.12 
 
 
414 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32 
 
 
392 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.1 
 
 
361 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.04 
 
 
422 aa  153  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  28.38 
 
 
436 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.99 
 
 
383 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  27.84 
 
 
369 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  29.69 
 
 
395 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.9 
 
 
420 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.95 
 
 
429 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.39 
 
 
407 aa  145  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.93 
 
 
394 aa  145  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.08 
 
 
383 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.15 
 
 
390 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.08 
 
 
383 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  29.23 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.13 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.93 
 
 
392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.16 
 
 
407 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  30.06 
 
 
392 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>