192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1987 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  77.25 
 
 
212 aa  343  8e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  46.63 
 
 
436 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44.71 
 
 
392 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.67 
 
 
390 aa  174  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.5 
 
 
380 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  45.45 
 
 
392 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  42.58 
 
 
392 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.27 
 
 
385 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  44.12 
 
 
404 aa  161  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.78 
 
 
385 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.58 
 
 
402 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.86 
 
 
400 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  45.64 
 
 
370 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  46.15 
 
 
361 aa  154  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.05 
 
 
422 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.84 
 
 
414 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.07 
 
 
396 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.38 
 
 
401 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.72 
 
 
398 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  43.52 
 
 
420 aa  147  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.54 
 
 
429 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.57 
 
 
414 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.23 
 
 
385 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.23 
 
 
398 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  46.37 
 
 
391 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.33 
 
 
404 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.71 
 
 
404 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.83 
 
 
404 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.33 
 
 
404 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.33 
 
 
403 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.33 
 
 
404 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.84 
 
 
403 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.33 
 
 
404 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.84 
 
 
404 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.84 
 
 
404 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0925  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39 
 
 
387 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000171827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.33 
 
 
404 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  43.15 
 
 
369 aa  141  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40 
 
 
410 aa  141  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.51 
 
 
407 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  40.38 
 
 
335 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.98 
 
 
413 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.33 
 
 
403 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  43.09 
 
 
387 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.94 
 
 
405 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.33 
 
 
389 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  45.45 
 
 
376 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.39 
 
 
401 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.5 
 
 
405 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.9 
 
 
400 aa  134  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.68 
 
 
389 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.7 
 
 
392 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000028573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.7 
 
 
392 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000522414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.94 
 
 
393 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.3 
 
 
383 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  48.03 
 
 
309 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.92 
 
 
407 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.92 
 
 
407 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.31 
 
 
383 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1035  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.76 
 
 
422 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.533687  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.36 
 
 
388 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.86 
 
 
383 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.62 
 
 
394 aa  129  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 
407 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.12 
 
 
385 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.97 
 
 
371 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.78 
 
 
392 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.59 
 
 
484 aa  125  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  39.66 
 
 
392 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  35.94 
 
 
400 aa  122  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.71 
 
 
416 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  37 
 
 
406 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000116963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  37.63 
 
 
392 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.13 
 
 
500 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.11 
 
 
474 aa  115  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.73 
 
 
406 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.78 
 
 
472 aa  114  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  33.01 
 
 
407 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  35.9 
 
 
502 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  35.03 
 
 
395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  36 
 
 
395 aa  107  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.57 
 
 
484 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.37 
 
 
381 aa  106  3e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.2 
 
 
392 aa  105  5e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.18 
 
 
484 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.18 
 
 
485 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.16 
 
 
475 aa  101  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.18 
 
 
484 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.01 
 
 
484 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.02 
 
 
473 aa  98.6  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.98 
 
 
483 aa  98.2  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.7 
 
 
484 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.7 
 
 
484 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.99 
 
 
484 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
482 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.7 
 
 
484 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
482 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
482 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
482 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>