153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5097 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  97.93 
 
 		 484 aa  983    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  77.69 
 
 		 484 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  78.1 
 
 		 484 aa  818    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  79.13 
 
 		 484 aa  823    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  80.37 
 
 		 484 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  77.89 
 
 		 484 aa  789    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  97.93 
 
 		 484 aa  983    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  79.55 
 
 		 484 aa  807    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  79.96 
 
 		 484 aa  815    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 		 484 aa  1001    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.28 
 
 		 484 aa  966    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  53.61 
 
 		 483 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.72 
 
 		 483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.24 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.86 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  50 
 
 		 484 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.65 
 
 		 482 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 482 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 482 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.72 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.79 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.72 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.72 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  50 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.55 
 
 		 484 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.75 
 
 		 482 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.21 
 
 		 482 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.83 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  50.83 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.83 
 
 		 482 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.69 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.17 
 
 		 484 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.83 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.83 
 
 		 482 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.03 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.62 
 
 		 482 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  50.41 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.55 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.72 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.73 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.55 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.79 
 
 		 482 aa  481  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.93 
 
 		 484 aa  478  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.73 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.33 
 
 		 486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.83 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.69 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.97 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.84 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.42 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.69 
 
 		 484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.26 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.5 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  33.75 
 
 		 502 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.25 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.03 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.3 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.87 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.83 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.83 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  30.25 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.75 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.93 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.25 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  36 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.3 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.01 
 
 		 380 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.13 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  30.08 
 
 		 392 aa  140  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.31 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.53 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.15 
 
 		 370 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 		 404 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.49 
 
 		 407 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.49 
 
 		 407 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.65 
 
 		 403 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.85 
 
 		 403 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.68 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.81 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  26.84 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.21 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.68 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  31.25 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.68 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>