156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0014 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 		 416 aa  837    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.72 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.01 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.79 
 
 		 472 aa  325  8.000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.38 
 
 		 475 aa  309  5e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.35 
 
 		 473 aa  286  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.34 
 
 		 371 aa  245  9e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.86 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  40.63 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  39.02 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.75 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  36.01 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.46 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  36.48 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.88 
 
 		 484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.71 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  34.93 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.39 
 
 		 361 aa  193  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.12 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.12 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.12 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.12 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.95 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.14 
 
 		 392 aa  189  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.01 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.89 
 
 		 482 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 		 484 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.89 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.21 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  33.89 
 
 		 482 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.89 
 
 		 482 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.89 
 
 		 482 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.89 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.81 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.71 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  38.15 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.68 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.66 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.68 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.68 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.46 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.98 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.06 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.06 
 
 		 482 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.96 
 
 		 484 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.61 
 
 		 515 aa  182  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.04 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.52 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.06 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.69 
 
 		 482 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.6 
 
 		 482 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.94 
 
 		 392 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.07 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.52 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  34.24 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.5 
 
 		 483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.77 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.68 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  33.63 
 
 		 392 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.88 
 
 		 515 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  35.55 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.96 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.15 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.25 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.63 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.53 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.16 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.93 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.19 
 
 		 410 aa  169  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.82 
 
 		 413 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.24 
 
 		 482 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.94 
 
 		 484 aa  169  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  33.43 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.18 
 
 		 465 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.25 
 
 		 393 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.22 
 
 		 484 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.73 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.15 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.05 
 
 		 404 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.05 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.05 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>