164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0070 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 
387 aa  787    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  49.17 
 
 
392 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  42.64 
 
 
404 aa  338  7e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.06 
 
 
361 aa  233  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.01 
 
 
406 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.78 
 
 
370 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  36.83 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  35.8 
 
 
436 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.34 
 
 
400 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.05 
 
 
383 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.28 
 
 
484 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.42 
 
 
385 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.57 
 
 
413 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.87 
 
 
383 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.14 
 
 
383 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.48 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.03 
 
 
371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  38.33 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  33.15 
 
 
395 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.87 
 
 
380 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.49 
 
 
407 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.49 
 
 
407 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.85 
 
 
472 aa  192  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.83 
 
 
474 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  38.77 
 
 
502 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.04 
 
 
422 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.87 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.93 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  29.69 
 
 
400 aa  182  1e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.78 
 
 
391 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.44 
 
 
407 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.61 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.66 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.82 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.97 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  32.77 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  31.42 
 
 
392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.59 
 
 
500 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.24 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.27 
 
 
401 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  31.64 
 
 
392 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.69 
 
 
402 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.08 
 
 
392 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.14 
 
 
398 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.64 
 
 
414 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.75 
 
 
414 aa  168  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.24 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.44 
 
 
389 aa  167  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.73 
 
 
398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.15 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.01 
 
 
475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.44 
 
 
393 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.61 
 
 
407 aa  162  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.52 
 
 
496 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.33 
 
 
473 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.97 
 
 
385 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  33.55 
 
 
309 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.89 
 
 
410 aa  159  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31 
 
 
388 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.51 
 
 
484 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.4 
 
 
484 aa  156  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.23 
 
 
389 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.29 
 
 
400 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.4 
 
 
482 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.51 
 
 
483 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.51 
 
 
483 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.51 
 
 
483 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.3 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  32.13 
 
 
482 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.13 
 
 
482 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.95 
 
 
483 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.71 
 
 
484 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.86 
 
 
482 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.86 
 
 
482 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.87 
 
 
484 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.86 
 
 
482 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.13 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.89 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.63 
 
 
404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.87 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.12 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.87 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.87 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.87 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.16 
 
 
381 aa  147  3e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.13 
 
 
482 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.53 
 
 
482 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.32 
 
 
482 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.69 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.06 
 
 
484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>