152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0512 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 
407 aa  811    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  58.02 
 
 
392 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  58.14 
 
 
395 aa  421  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  56.6 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  39.64 
 
 
436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.75 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  38.72 
 
 
335 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.71 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.85 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  36.13 
 
 
404 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  33.05 
 
 
387 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.24 
 
 
484 aa  176  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  38.01 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.57 
 
 
371 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.51 
 
 
392 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  31.22 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.38 
 
 
474 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.51 
 
 
493 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.28 
 
 
472 aa  162  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.69 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.95 
 
 
482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.25 
 
 
500 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.41 
 
 
484 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.99 
 
 
398 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.08 
 
 
482 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.59 
 
 
482 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.83 
 
 
484 aa  150  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  27.08 
 
 
383 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.85 
 
 
413 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.29 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.29 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  30 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.42 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  34.5 
 
 
502 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  33 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.89 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.51 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.56 
 
 
482 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.94 
 
 
482 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.11 
 
 
376 aa  145  9e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.55 
 
 
389 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.55 
 
 
404 aa  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.39 
 
 
414 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
482 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.25 
 
 
429 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.05 
 
 
484 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  26.82 
 
 
383 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.81 
 
 
515 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.46 
 
 
484 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  27.42 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.5 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.61 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.05 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.23 
 
 
483 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.62 
 
 
414 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.83 
 
 
482 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.34 
 
 
484 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.34 
 
 
484 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.92 
 
 
486 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.34 
 
 
484 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.59 
 
 
483 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.59 
 
 
483 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.59 
 
 
483 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.92 
 
 
396 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.61 
 
 
484 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.68 
 
 
485 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.23 
 
 
420 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.5 
 
 
484 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.16 
 
 
407 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.72 
 
 
515 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.04 
 
 
402 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  26.97 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.87 
 
 
400 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.59 
 
 
398 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.61 
 
 
484 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.61 
 
 
484 aa  137  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.23 
 
 
484 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.91 
 
 
484 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.23 
 
 
484 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.72 
 
 
484 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.18 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.97 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.14 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  27.49 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.32 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.99 
 
 
484 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.99 
 
 
484 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>