162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00371 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
482 aa  987    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  99.38 
 
 
482 aa  984    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 
484 aa  634    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 
484 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.47 
 
 
482 aa  965    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.47 
 
 
482 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  68.48 
 
 
484 aa  716    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 
484 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 
484 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  98.76 
 
 
482 aa  974    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  85.89 
 
 
482 aa  875    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 
484 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  85.68 
 
 
482 aa  866    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.98 
 
 
484 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 
484 aa  634    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.79 
 
 
482 aa  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  87.34 
 
 
515 aa  885    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 
484 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 
484 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  85.48 
 
 
482 aa  860    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.1 
 
 
482 aa  873    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  62.45 
 
 
482 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  987    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  66.88 
 
 
465 aa  654    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 
484 aa  634    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.57 
 
 
483 aa  823    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.27 
 
 
482 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.47 
 
 
482 aa  965    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  64.73 
 
 
482 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
482 aa  987    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.59 
 
 
482 aa  985    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.57 
 
 
482 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 
484 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 
484 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.17 
 
 
482 aa  983    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.27 
 
 
482 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.57 
 
 
483 aa  823    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.57 
 
 
483 aa  823    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.59 
 
 
482 aa  986    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.54 
 
 
484 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 
484 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.54 
 
 
485 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  64.8 
 
 
515 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 
484 aa  630  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 
484 aa  621  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  58.23 
 
 
486 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.69 
 
 
483 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.99 
 
 
484 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.89 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.65 
 
 
484 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.48 
 
 
484 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.89 
 
 
484 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.45 
 
 
484 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.45 
 
 
484 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.24 
 
 
484 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  49.79 
 
 
484 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  50 
 
 
484 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.21 
 
 
484 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.97 
 
 
483 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.9 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.87 
 
 
478 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.35 
 
 
496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.75 
 
 
500 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.79 
 
 
484 aa  273  7e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.68 
 
 
493 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  34.58 
 
 
502 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.87 
 
 
472 aa  213  7e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.85 
 
 
474 aa  200  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.84 
 
 
416 aa  189  9e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.52 
 
 
371 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.87 
 
 
475 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.36 
 
 
473 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.32 
 
 
392 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.97 
 
 
370 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.76 
 
 
383 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.48 
 
 
383 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.15 
 
 
380 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  28.72 
 
 
436 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.75 
 
 
383 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.35 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  28.8 
 
 
369 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.2 
 
 
361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.77 
 
 
390 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.81 
 
 
403 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  32.13 
 
 
387 aa  151  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.71 
 
 
400 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.64 
 
 
395 aa  150  5e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.73 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.85 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.75 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.35 
 
 
404 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.35 
 
 
403 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.35 
 
 
404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.66 
 
 
385 aa  147  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.1 
 
 
404 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.75 
 
 
385 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.44 
 
 
402 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>