165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2785 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.2 
 
 		 484 aa  829    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.89 
 
 		 486 aa  828    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.23 
 
 		 484 aa  837    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.02 
 
 		 484 aa  835    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 		 484 aa  995    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.02 
 
 		 484 aa  835    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  79.13 
 
 		 484 aa  801    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.61 
 
 		 484 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  78.93 
 
 		 485 aa  814    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  83.06 
 
 		 484 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.61 
 
 		 484 aa  840    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 		 482 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.61 
 
 		 484 aa  840    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.6 
 
 		 483 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.6 
 
 		 483 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  78.31 
 
 		 484 aa  808    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  78.1 
 
 		 484 aa  806    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  78.93 
 
 		 484 aa  814    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  81.61 
 
 		 484 aa  840    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.6 
 
 		 483 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.33 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.92 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 		 484 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.92 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 		 484 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.09 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.09 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.09 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.09 
 
 		 482 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.3 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.09 
 
 		 482 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  60.12 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.33 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 		 482 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.92 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  59.71 
 
 		 482 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 		 482 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.63 
 
 		 482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.5 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.36 
 
 		 482 aa  591  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  58.47 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.03 
 
 		 465 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  55.51 
 
 		 484 aa  561  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.96 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.69 
 
 		 483 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.35 
 
 		 484 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.55 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.14 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.93 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.73 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.73 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.93 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.93 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.28 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  45.45 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.66 
 
 		 484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.25 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.07 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.66 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.63 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.74 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.96 
 
 		 493 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.18 
 
 		 500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  31.81 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.16 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.27 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.39 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.45 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.03 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.3 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.69 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.79 
 
 		 475 aa  159  8e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.05 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.5 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.1 
 
 		 406 aa  154  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.37 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  28.17 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.71 
 
 		 361 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.66 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.16 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.94 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.1 
 
 		 398 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  29.27 
 
 		 407 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.99 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.42 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.08 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  30.45 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.03 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.17 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.78 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.05 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.78 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  28.53 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.38 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.08 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  30.31 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.74 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>