154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2118 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
496 aa  997    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.19 
 
 
515 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.79 
 
 
482 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.99 
 
 
482 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.94 
 
 
484 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.99 
 
 
482 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.79 
 
 
482 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.99 
 
 
482 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.79 
 
 
482 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.99 
 
 
485 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.17 
 
 
482 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.06 
 
 
484 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.06 
 
 
484 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.65 
 
 
484 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.06 
 
 
484 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.67 
 
 
484 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.67 
 
 
484 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.76 
 
 
482 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.65 
 
 
484 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.67 
 
 
484 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.67 
 
 
484 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.42 
 
 
484 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.5 
 
 
484 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.42 
 
 
484 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.56 
 
 
482 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.15 
 
 
482 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.38 
 
 
484 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.42 
 
 
484 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.29 
 
 
483 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.97 
 
 
482 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.29 
 
 
483 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.42 
 
 
484 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.29 
 
 
483 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.54 
 
 
484 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.83 
 
 
484 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.12 
 
 
484 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  43.56 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.96 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.74 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.35 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.35 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.56 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.35 
 
 
482 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  43.35 
 
 
482 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.71 
 
 
484 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.35 
 
 
482 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.35 
 
 
482 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  44.99 
 
 
484 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.63 
 
 
484 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.92 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.54 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.4 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.74 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.51 
 
 
486 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.49 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.63 
 
 
484 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.33 
 
 
482 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.7 
 
 
478 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.84 
 
 
483 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.33 
 
 
482 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.01 
 
 
465 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.92 
 
 
515 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.38 
 
 
493 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.29 
 
 
484 aa  237  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.21 
 
 
500 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.99 
 
 
472 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.3 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.3 
 
 
400 aa  193  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  32.43 
 
 
502 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.68 
 
 
390 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.61 
 
 
371 aa  177  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.84 
 
 
475 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  33.52 
 
 
387 aa  170  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.07 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.56 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.88 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.5 
 
 
420 aa  163  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.37 
 
 
402 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.77 
 
 
392 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.46 
 
 
404 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.59 
 
 
404 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.32 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.32 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.35 
 
 
401 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.32 
 
 
403 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.32 
 
 
404 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.05 
 
 
404 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.05 
 
 
404 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.83 
 
 
392 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.25 
 
 
398 aa  156  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.65 
 
 
370 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.66 
 
 
391 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  29.73 
 
 
404 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.89 
 
 
400 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.77 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.95 
 
 
389 aa  154  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.14 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.77 
 
 
404 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.29 
 
 
403 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.69 
 
 
422 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>