159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1081 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.57 
 
 		 482 aa  814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  82.78 
 
 		 482 aa  814    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  62.19 
 
 		 484 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.73 
 
 		 484 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  82.57 
 
 		 482 aa  814    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  66.88 
 
 		 465 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  83.82 
 
 		 482 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  83.82 
 
 		 482 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  68.68 
 
 		 484 aa  707    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.93 
 
 		 484 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.93 
 
 		 484 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.37 
 
 		 482 aa  832    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  64.11 
 
 		 482 aa  650    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.93 
 
 		 484 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.1 
 
 		 482 aa  871    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.31 
 
 		 482 aa  871    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.91 
 
 		 484 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.16 
 
 		 515 aa  827    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.52 
 
 		 484 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.54 
 
 		 482 aa  811    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.91 
 
 		 484 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.91 
 
 		 484 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.13 
 
 		 483 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  83.82 
 
 		 482 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  84.02 
 
 		 482 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  65.35 
 
 		 482 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.57 
 
 		 482 aa  814    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.57 
 
 		 482 aa  812    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 		 482 aa  991    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.52 
 
 		 484 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.91 
 
 		 484 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.72 
 
 		 482 aa  870    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  84.02 
 
 		 482 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.13 
 
 		 483 aa  867    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.13 
 
 		 483 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.78 
 
 		 482 aa  815    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  84.85 
 
 		 482 aa  857    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.99 
 
 		 482 aa  815    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.57 
 
 		 484 aa  631  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 485 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  65.01 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.12 
 
 		 484 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  622  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.67 
 
 		 484 aa  621  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.63 
 
 		 486 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.62 
 
 		 483 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.24 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.45 
 
 		 484 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.03 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.83 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.34 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.83 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.65 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.44 
 
 		 484 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.66 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  48.14 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.55 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  47 
 
 		 483 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.69 
 
 		 484 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.02 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.97 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.54 
 
 		 500 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.63 
 
 		 484 aa  267  4e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.82 
 
 		 493 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  33.19 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 		 472 aa  202  8e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.6 
 
 		 474 aa  190  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.06 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.24 
 
 		 371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.91 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.27 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.81 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.71 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.09 
 
 		 383 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.82 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.42 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.55 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  30.29 
 
 		 392 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.97 
 
 		 370 aa  150  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.41 
 
 		 380 aa  150  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.22 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  31.32 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.76 
 
 		 402 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.33 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.03 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  27.41 
 
 		 436 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.3 
 
 		 385 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  27.15 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.76 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  31.9 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.65 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  32.08 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  33.91 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.29 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.57 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.82 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.29 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.28 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.28 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>