157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0466 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.47 
 
 		 482 aa  937    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  96.68 
 
 		 482 aa  939    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.72 
 
 		 482 aa  866    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.79 
 
 		 482 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 		 482 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  69.1 
 
 		 484 aa  720    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.06 
 
 		 482 aa  959    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.93 
 
 		 482 aa  879    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 		 484 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.78 
 
 		 484 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  89.42 
 
 		 515 aa  899    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 		 484 aa  634    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.26 
 
 		 482 aa  934    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  96.47 
 
 		 482 aa  937    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  64.11 
 
 		 482 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  67.74 
 
 		 465 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.61 
 
 		 483 aa  828    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.79 
 
 		 482 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  87.14 
 
 		 482 aa  883    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.59 
 
 		 482 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  64.94 
 
 		 482 aa  668    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.47 
 
 		 482 aa  937    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.27 
 
 		 482 aa  935    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  83.82 
 
 		 482 aa  839    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.95 
 
 		 484 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  86.93 
 
 		 482 aa  870    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  99.59 
 
 		 482 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.61 
 
 		 483 aa  828    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  82.61 
 
 		 483 aa  828    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.47 
 
 		 482 aa  938    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  96.89 
 
 		 482 aa  941    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 		 484 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 		 484 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  60.54 
 
 		 485 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  65.22 
 
 		 515 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 		 484 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 		 484 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.71 
 
 		 484 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  61.16 
 
 		 484 aa  627  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  59.09 
 
 		 484 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  57.61 
 
 		 486 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  53.31 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.16 
 
 		 484 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.48 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.83 
 
 		 484 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  52.48 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  51.45 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.41 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  49.79 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  50 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  50.21 
 
 		 484 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  49.59 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  48.56 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.9 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.87 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.79 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.97 
 
 		 500 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.17 
 
 		 484 aa  264  3e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.32 
 
 		 493 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  34.03 
 
 		 502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.95 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.56 
 
 		 474 aa  196  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.73 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.61 
 
 		 416 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.58 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.86 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.68 
 
 		 473 aa  176  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.02 
 
 		 383 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.96 
 
 		 370 aa  166  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.01 
 
 		 383 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.86 
 
 		 380 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.28 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.75 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  27.95 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.33 
 
 		 403 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.17 
 
 		 400 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.68 
 
 		 361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.8 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.89 
 
 		 404 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  32.13 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  28.5 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.85 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.64 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.1 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.85 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.85 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.6 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.75 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.67 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.08 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.35 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.06 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>