66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2769 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  46.86 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  50.79 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  46.96 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  46.75 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  46.9 
 
 		 329 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  40.75 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  40.13 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  43.79 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  40.65 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  38.48 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  41.19 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  39.43 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  42.86 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  40.58 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  43.73 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  42.57 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  43.39 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  37.42 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  40.6 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  40.6 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  41.75 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  40 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  37.42 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  42.09 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  40.3 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  39.76 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.7 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  37.98 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.81 
 
 		 329 aa  212  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  39.8 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  41.89 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  36.53 
 
 		 329 aa  205  7e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  34.49 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  40.33 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  37.15 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  35.69 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  34.41 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  37.11 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  41.03 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  37.5 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  37.93 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.4 
 
 		 407 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.03 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.03 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0710  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.67 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1750  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  34.88 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0112928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8108  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  27.04 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.95515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.27 
 
 		 380 aa  46.2  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.36 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  27.06 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2351  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  0.10209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1354  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.1 
 
 		 488 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.79 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0345037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1486  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.78 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000391444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  23.51 
 
 		 404 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6834  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  32.76 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.560399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  26.35 
 
 		 388 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0841  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.19 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2569  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30.89 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1492  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  31.07 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1784  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.63 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.397888  hitchhiker  0.0072174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  34.04 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2905  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.91 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000328107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1762  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  24.56 
 
 		 392 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31241  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1513  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.88 
 
 		 370 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.702789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>