73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3179 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 		 357 aa  732    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  53.35 
 
 		 368 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  51.14 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  53.67 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  51.37 
 
 		 349 aa  342  9e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  50.78 
 
 		 376 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  40.97 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  38.15 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  39.53 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  35.61 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  37.15 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  40.71 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  36.49 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  35.99 
 
 		 334 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  47 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  32.1 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  46 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  39.31 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  35.78 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  38.55 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  36.13 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  41.96 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  41.96 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  31.11 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  41.96 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  40.81 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.53 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  36.68 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  43.14 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  34.39 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  35.37 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  43.72 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  36.59 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  36.46 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  35.23 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  36.12 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  36.1 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  36.1 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  36.76 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  37.6 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  37.86 
 
 		 347 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  25.51 
 
 		 361 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.92 
 
 		 482 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.92 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.92 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.92 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.92 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.92 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.92 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2569  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.37 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.26 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0873  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  30.16 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003729 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  28.7 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.55 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00980  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  23.04 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.63 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2897  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  31.03 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>