More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1045 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  100 
 
 
409 aa  840    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  99.76 
 
 
409 aa  838    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  55.99 
 
 
418 aa  484  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  54.7 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  52.85 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  54.46 
 
 
401 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  52.45 
 
 
430 aa  443  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  53.87 
 
 
407 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01883  arginosuccinate synthetase (Eurofung)  52.81 
 
 
416 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  54.89 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  52.97 
 
 
414 aa  438  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_006686  CND00700  argininosuccinate synthase, putative  52.01 
 
 
429 aa  435  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  52.08 
 
 
408 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  53.52 
 
 
397 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  52.36 
 
 
401 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  53.09 
 
 
403 aa  428  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  53.85 
 
 
401 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  52.04 
 
 
399 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  52.09 
 
 
406 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  52.71 
 
 
408 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  53.45 
 
 
405 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  52.18 
 
 
396 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  52.59 
 
 
401 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  51.36 
 
 
406 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  52.08 
 
 
409 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 
406 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  51.1 
 
 
402 aa  420  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  52.36 
 
 
399 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  52.11 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  51.59 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
405 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  52.12 
 
 
409 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 
404 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  51.24 
 
 
406 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  50.62 
 
 
407 aa  411  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  51.36 
 
 
419 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  51.01 
 
 
397 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  53.83 
 
 
416 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34492  argininosuccinate synthetase  50.87 
 
 
416 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.491384  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  53.2 
 
 
406 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 
409 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  50.99 
 
 
406 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  50.86 
 
 
401 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  52.62 
 
 
419 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  52.37 
 
 
405 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
407 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  49.63 
 
 
402 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  50.12 
 
 
408 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  51.63 
 
 
1496 aa  411  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  51.37 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  50.12 
 
 
402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  50 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  49.51 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  51.34 
 
 
407 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  51 
 
 
407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
406 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  51.37 
 
 
407 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  49.25 
 
 
404 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  50 
 
 
399 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  52.59 
 
 
403 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 
406 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
404 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 
406 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
405 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
407 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
406 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  53.06 
 
 
410 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  52.21 
 
 
409 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  51.73 
 
 
407 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  50.5 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  52.07 
 
 
412 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  51.26 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  51.85 
 
 
409 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  48.54 
 
 
408 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
409 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  51.73 
 
 
426 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  52.35 
 
 
409 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  52.23 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  51.58 
 
 
413 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
403 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
408 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 
405 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  51.34 
 
 
413 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  49.63 
 
 
399 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  48.54 
 
 
410 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  47.8 
 
 
410 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  49.25 
 
 
408 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  49.63 
 
 
399 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
407 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  51.58 
 
 
413 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  51 
 
 
407 aa  396  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>