More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1345 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 404 aa  833    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  85.86 
 
 		 405 aa  728    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  73.75 
 
 		 401 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  73.82 
 
 		 401 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  71.75 
 
 		 401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  69.83 
 
 		 408 aa  589  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  66.58 
 
 		 410 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  66.75 
 
 		 407 aa  567  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  66.17 
 
 		 403 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  64.99 
 
 		 1496 aa  557  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  65.82 
 
 		 403 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  65.39 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  63.52 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  62.44 
 
 		 407 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  61.52 
 
 		 402 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  60.71 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  60.9 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  59.14 
 
 		 403 aa  501  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  59.5 
 
 		 403 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  59.9 
 
 		 407 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  58.29 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  59.95 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  56 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  58.23 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  56 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  56.38 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  54.55 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  57.79 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  56.03 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  57.43 
 
 		 406 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  54.52 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  55.84 
 
 		 403 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  54.83 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  54.48 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  54.68 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  54.39 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  57.36 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  57.14 
 
 		 412 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  54.24 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  56.06 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  55.28 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  56.31 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  57.4 
 
 		 410 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  54.16 
 
 		 410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  57.11 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  54.85 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  53.28 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  54.66 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  55.81 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  53.6 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  53.38 
 
 		 406 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  55.92 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  52.75 
 
 		 413 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  54.75 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  52.88 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  53.38 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  54.43 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  55.58 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  54.59 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  54.14 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  55.58 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  54.27 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  54.06 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  55.42 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  54.59 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  54.59 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  54.29 
 
 		 407 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  54.59 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  54.59 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  55.42 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  52.78 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  53.81 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  55.08 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  54.43 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  54.29 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  52.66 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  53.3 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  54.71 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  52.5 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  53.4 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  52.91 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  55.16 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 		 403 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  52.53 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  53.4 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  53.45 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  52.53 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  51.13 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  52.15 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  52.53 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  54.87 
 
 		 407 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  54.18 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>