More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0688 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  100 
 
 
408 aa  846    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  63.01 
 
 
430 aa  548  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  62.78 
 
 
397 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  62.06 
 
 
403 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  61.71 
 
 
400 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  60.3 
 
 
401 aa  508  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  62.28 
 
 
406 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  62.15 
 
 
399 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  61.29 
 
 
397 aa  498  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  61.4 
 
 
406 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  59.26 
 
 
403 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  61.15 
 
 
406 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  60.55 
 
 
407 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  60.05 
 
 
411 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  59.9 
 
 
405 aa  488  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  59.3 
 
 
419 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  58.9 
 
 
402 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  59.71 
 
 
406 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  59.41 
 
 
406 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  59.2 
 
 
401 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  59.16 
 
 
406 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  58.4 
 
 
410 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  58.9 
 
 
406 aa  484  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  58.4 
 
 
403 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  57.56 
 
 
409 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  59.55 
 
 
414 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  56.97 
 
 
407 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  58.84 
 
 
396 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  58.4 
 
 
405 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  58.04 
 
 
402 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  57.89 
 
 
407 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  58.79 
 
 
412 aa  481  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
405 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  58.69 
 
 
403 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  57.04 
 
 
405 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
405 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  57.39 
 
 
408 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  57.64 
 
 
404 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  58.54 
 
 
412 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
405 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 
405 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  57.04 
 
 
405 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
405 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  58.72 
 
 
408 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
405 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  56.28 
 
 
405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  56.28 
 
 
405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  58.46 
 
 
468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  56.86 
 
 
408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  56.86 
 
 
419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 
409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
406 aa  467  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  57.21 
 
 
409 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 
407 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  56.72 
 
 
409 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  56.11 
 
 
408 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  56.19 
 
 
399 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  56.68 
 
 
402 aa  463  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  58 
 
 
405 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  56.28 
 
 
409 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  56.89 
 
 
408 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  56.19 
 
 
399 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  57.04 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  57.95 
 
 
410 aa  458  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  56.89 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  56.5 
 
 
409 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  56.28 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  56.64 
 
 
406 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  56.25 
 
 
409 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 
406 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  56.28 
 
 
407 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  56 
 
 
408 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
406 aa  454  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  56.03 
 
 
409 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
412 aa  454  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  56.39 
 
 
406 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  56.61 
 
 
410 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  58.04 
 
 
401 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  56.25 
 
 
416 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  56.39 
 
 
406 aa  457  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  56.36 
 
 
410 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  56.25 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  56.25 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  55.5 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  54.39 
 
 
407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  54.89 
 
 
409 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  55.5 
 
 
413 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  55.75 
 
 
413 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  55.5 
 
 
408 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  56.25 
 
 
413 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  55.03 
 
 
405 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  55.5 
 
 
408 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  56.14 
 
 
409 aa  448  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  55.56 
 
 
397 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  55.75 
 
 
413 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  54.46 
 
 
407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>