More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3638 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  86.85 
 
 		 406 aa  747    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  91.38 
 
 		 406 aa  786    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  73.87 
 
 		 406 aa  634    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  88.15 
 
 		 405 aa  751    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  86.7 
 
 		 406 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  99.01 
 
 		 406 aa  840    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 406 aa  845    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  83.66 
 
 		 408 aa  726    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  66.83 
 
 		 419 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 401 aa  564  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  65.91 
 
 		 408 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  66.84 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  65.68 
 
 		 405 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  66.24 
 
 		 404 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  65.66 
 
 		 407 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  66.08 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  66.58 
 
 		 405 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  65.91 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  65.82 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  65.19 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  65.43 
 
 		 405 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  66.08 
 
 		 407 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  65.1 
 
 		 405 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  64.85 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  65.57 
 
 		 405 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  64.81 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  64.14 
 
 		 406 aa  541  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  65.1 
 
 		 405 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  64.94 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  65.57 
 
 		 405 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  65.33 
 
 		 409 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  62.16 
 
 		 409 aa  535  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  62.94 
 
 		 403 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  65.9 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  63.48 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  64.52 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  62.53 
 
 		 407 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  63.48 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  63.96 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  62.78 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  63.22 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  63.64 
 
 		 410 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  62.91 
 
 		 407 aa  531  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  63.82 
 
 		 468 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  62.59 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  62.41 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  64.07 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  63.22 
 
 		 404 aa  526  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  63.8 
 
 		 408 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  62.41 
 
 		 407 aa  527  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  61.96 
 
 		 405 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  63.54 
 
 		 408 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  61.83 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  61.71 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  63.98 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  63.54 
 
 		 408 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  62.68 
 
 		 412 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  62.12 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  61.58 
 
 		 409 aa  521  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  63.07 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  63.54 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  62.63 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  62.56 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  64.27 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  62.66 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  62.66 
 
 		 409 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  62.81 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  61.07 
 
 		 407 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  62.66 
 
 		 409 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  62.69 
 
 		 402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  62.56 
 
 		 408 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  62.56 
 
 		 408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  63.17 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  63.48 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  62.72 
 
 		 407 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  62.72 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  62.56 
 
 		 410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  62.5 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  63.07 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  60.9 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  61.73 
 
 		 407 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  63.22 
 
 		 409 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  60.9 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  62.63 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  62.53 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  62.5 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  62.4 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  62.5 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  60.45 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  61.63 
 
 		 408 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  62.31 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  62.28 
 
 		 406 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  59.75 
 
 		 411 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  61.48 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  62.28 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  61.03 
 
 		 405 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  62.28 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  63.75 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  62.03 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>