More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2674 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  76.35 
 
 
403 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  77.92 
 
 
405 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  76.79 
 
 
408 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  78.61 
 
 
405 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  77.92 
 
 
405 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  100 
 
 
409 aa  845    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  77.64 
 
 
405 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  77.64 
 
 
405 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  86.6 
 
 
468 aa  749    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  79.6 
 
 
404 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  86.27 
 
 
410 aa  731    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  87.25 
 
 
409 aa  748    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  78.13 
 
 
405 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  78.16 
 
 
406 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  81.86 
 
 
407 aa  703    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  86.03 
 
 
406 aa  739    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  84.84 
 
 
408 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  75.62 
 
 
406 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  75.12 
 
 
407 aa  636    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  84.31 
 
 
410 aa  719    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  80.8 
 
 
402 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  77.67 
 
 
405 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  77.92 
 
 
405 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  85.09 
 
 
408 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  77.67 
 
 
405 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  78.16 
 
 
405 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  77.86 
 
 
403 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  75.31 
 
 
405 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  75.12 
 
 
409 aa  630  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  74.44 
 
 
407 aa  628  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  74.63 
 
 
410 aa  624  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  72.97 
 
 
409 aa  622  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  74.94 
 
 
407 aa  614  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  74 
 
 
406 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1219  argininosuccinate synthase  73.43 
 
 
407 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.099929  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  73.75 
 
 
406 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  76.57 
 
 
399 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  73.75 
 
 
406 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  76.57 
 
 
399 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  73.7 
 
 
408 aa  608  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  71.82 
 
 
411 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  70 
 
 
406 aa  598  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  71.6 
 
 
402 aa  600  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  71.85 
 
 
404 aa  599  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  71.75 
 
 
412 aa  599  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  71.25 
 
 
412 aa  595  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0754  argininosuccinate synthase  71.68 
 
 
406 aa  594  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1976  argininosuccinate synthase  72.84 
 
 
419 aa  596  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  70.44 
 
 
409 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  69.68 
 
 
409 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  70.22 
 
 
419 aa  579  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  70.34 
 
 
412 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  69.21 
 
 
409 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  70.2 
 
 
413 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  70.69 
 
 
413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  69.95 
 
 
413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  68.8 
 
 
408 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  70.43 
 
 
409 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  68.8 
 
 
408 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  69.32 
 
 
413 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  69.95 
 
 
413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  71.72 
 
 
410 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  68.06 
 
 
408 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  69.52 
 
 
409 aa  564  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  70.47 
 
 
405 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  68.59 
 
 
416 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  68.07 
 
 
402 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  69.5 
 
 
426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  69 
 
 
407 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  70.13 
 
 
405 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  71.17 
 
 
404 aa  559  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  68.38 
 
 
408 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  67.91 
 
 
407 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  68.63 
 
 
406 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  68.75 
 
 
405 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  68.25 
 
 
412 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  67.5 
 
 
406 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  67.5 
 
 
406 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  67.83 
 
 
407 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  67 
 
 
407 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  67.83 
 
 
409 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  64.29 
 
 
406 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  65.33 
 
 
406 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  65.33 
 
 
406 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  67.57 
 
 
419 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  67.24 
 
 
410 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1361  argininosuccinate synthase  67.08 
 
 
407 aa  534  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.515773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  63.05 
 
 
408 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  63.79 
 
 
406 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  65.5 
 
 
407 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  62.32 
 
 
405 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  64.39 
 
 
404 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  62.65 
 
 
403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  60.84 
 
 
406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  60.84 
 
 
406 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0367  argininosuccinate synthase  63.38 
 
 
393 aa  503  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  63.71 
 
 
399 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  60.45 
 
 
397 aa  501  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0680  argininosuccinate synthase  63.38 
 
 
393 aa  503  1e-141  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.90622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  60.74 
 
 
401 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>