More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4058 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  100 
 
 
407 aa  842    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  96.02 
 
 
402 aa  804    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  74.5 
 
 
403 aa  631  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 
401 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  64.62 
 
 
405 aa  541  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  62.44 
 
 
404 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  62.22 
 
 
401 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  64.23 
 
 
401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  59.19 
 
 
410 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  60.96 
 
 
408 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  60.15 
 
 
405 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  59.49 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  57 
 
 
401 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  57.29 
 
 
1496 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  58.56 
 
 
407 aa  485  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  58.88 
 
 
399 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  56.22 
 
 
399 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  55.11 
 
 
406 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  58.19 
 
 
403 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  56.68 
 
 
406 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  60.55 
 
 
399 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0230  argininosuccinate synthase  55.7 
 
 
412 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.633621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  56.17 
 
 
406 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0463  argininosuccinate synthase  54.28 
 
 
418 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  58.57 
 
 
397 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  57.14 
 
 
407 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  55.97 
 
 
406 aa  474  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  55.95 
 
 
408 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  57.28 
 
 
406 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  57.36 
 
 
403 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4273  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 
407 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.898095  normal  0.346198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  55.58 
 
 
403 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4092  argininosuccinate synthase  55.7 
 
 
412 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4121  argininosuccinate synthase  55.7 
 
 
412 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
400 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 
401 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4011  argininosuccinate synthase  55.7 
 
 
412 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  55.16 
 
 
407 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3714  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 
407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  55.75 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  58.82 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  55.45 
 
 
404 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4210  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  56 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  55.33 
 
 
407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0231  argininosuccinate synthase  54.16 
 
 
402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000109496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  55.39 
 
 
406 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0278  argininosuccinate synthase  54.94 
 
 
407 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  55.39 
 
 
406 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  57.11 
 
 
399 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
413 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  56.92 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  56.58 
 
 
403 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3706  argininosuccinate synthase  54.68 
 
 
407 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0239  argininosuccinate synthase  54.68 
 
 
407 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3902  argininosuccinate synthase  54.68 
 
 
407 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.940793  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  54.86 
 
 
408 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  55.42 
 
 
414 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0194  argininosuccinate synthase  54.36 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0253  argininosuccinate synthase  53.85 
 
 
407 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2758  argininosuccinate synthase  54.24 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  55.08 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  55.42 
 
 
402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  53.69 
 
 
404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  54.96 
 
 
419 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  55.05 
 
 
407 aa  450  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  54.46 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002314  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  54.61 
 
 
407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
411 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00041  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 
404 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  54.64 
 
 
409 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  53 
 
 
409 aa  441  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  53.88 
 
 
406 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  53.38 
 
 
410 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  54.61 
 
 
404 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  52.83 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  55.11 
 
 
410 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  52.49 
 
 
407 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  52.84 
 
 
400 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  52.51 
 
 
402 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  52.84 
 
 
407 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  52.88 
 
 
409 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  54.29 
 
 
419 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  53.54 
 
 
406 aa  431  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  52.32 
 
 
401 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  53.5 
 
 
405 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  54.81 
 
 
410 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
402 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  52.32 
 
 
400 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  53.33 
 
 
404 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  53.28 
 
 
406 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  52.58 
 
 
400 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 
405 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 
412 aa  430  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  53.98 
 
 
406 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  52.93 
 
 
408 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  53.65 
 
 
403 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  52.66 
 
 
406 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>