More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0559 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0559  Argininosuccinate synthase  100 
 
 
430 aa  886    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.487039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  63.01 
 
 
408 aa  548  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  57.01 
 
 
403 aa  481  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  56.41 
 
 
406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  55.08 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  55.21 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  55.16 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  56.53 
 
 
397 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  55.98 
 
 
407 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  54.07 
 
 
401 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  55.24 
 
 
411 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  54.5 
 
 
405 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 
409 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  54.5 
 
 
405 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  54 
 
 
399 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  54.74 
 
 
405 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  53.92 
 
 
405 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  53.08 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  54.27 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  54.55 
 
 
403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  53.32 
 
 
405 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  53.88 
 
 
408 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  53.22 
 
 
405 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 
405 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  52.97 
 
 
404 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  53.52 
 
 
402 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  53.49 
 
 
407 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  54.52 
 
 
412 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  53.22 
 
 
403 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  53.88 
 
 
402 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 
405 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  52.63 
 
 
408 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  54.16 
 
 
403 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  53.44 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  51.9 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  51.65 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  52.86 
 
 
407 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  54.39 
 
 
397 aa  448  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 
406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1067  argininosuccinate synthase  52.45 
 
 
409 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  52.38 
 
 
405 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  52.14 
 
 
405 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  54.05 
 
 
412 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  52.98 
 
 
406 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 
406 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 
406 aa  441  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1045  argininosuccinate synthase  52.45 
 
 
409 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  52.27 
 
 
406 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  53.02 
 
 
409 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  53.36 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  52.39 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  51.78 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  54.25 
 
 
409 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  53.65 
 
 
399 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  53.66 
 
 
401 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  51.79 
 
 
406 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21116  predicted protein  50.82 
 
 
418 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  53.18 
 
 
408 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  51.88 
 
 
407 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0692  argininosuccinate synthase  52.02 
 
 
406 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  51.88 
 
 
409 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  53.65 
 
 
399 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0767  argininosuccinate synthase  51.78 
 
 
406 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  52.25 
 
 
406 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  53.18 
 
 
408 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  53.07 
 
 
468 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1334  argininosuccinate synthase  52.02 
 
 
406 aa  435  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  52.25 
 
 
406 aa  431  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  51.88 
 
 
407 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 
419 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  52.14 
 
 
409 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 
406 aa  431  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  52.1 
 
 
401 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  51.91 
 
 
401 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  51.54 
 
 
407 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  51.9 
 
 
406 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  52.97 
 
 
405 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  52.49 
 
 
409 aa  430  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  50.92 
 
 
410 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 
412 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  51.4 
 
 
408 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 
413 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  51.05 
 
 
405 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  51.51 
 
 
407 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  52.82 
 
 
405 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  52.49 
 
 
404 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  50.83 
 
 
402 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  52.69 
 
 
409 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  52.07 
 
 
408 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  50.7 
 
 
409 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  50.93 
 
 
412 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
402 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 
413 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  50.7 
 
 
403 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  51.03 
 
 
409 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  50.47 
 
 
404 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  50.93 
 
 
413 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  50.72 
 
 
1496 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  52.34 
 
 
401 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  50.59 
 
 
407 aa  422  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>